مقایسه پروفایل بیان افتراقی ژن‌های کاندیدا مرتبط با صفت باروری در گاوهای هلشتاین با استفاده از ‏دیدگاه ترانسکریپتوم و مبتنی بر فناوری ‏RNA-Seq

فرزاد غفوری؛ مصطفی صادقی؛ ابوالفضل بهرامی؛ رستم عبدالهی آرپناهی؛ آرش جوانمرد؛ سید رضا میرائی آشتیانی

دوره 52، شماره 4 ، بهمن 1400، ، صفحه 217-229

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2021.322630.653824

چکیده
  انتخاب ژنتیکی برای افزایش تولید شیر و سودآوری اقتصادی در صنعت گاوهای شیری با کاهش عملکرد تولیدمثلی از جمله کاهش زنده‌مانی رویان و افزایش از دست رفتن آبستنی همراه بوده است. در پژوهش حاضر، هدف اصلی، استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت آندومتریوم و جسم زرد دو دسته از گاوهای شیری هلشتاین با باروری بالا و پایین، به منظور شناسایی ژن‌های ...  بیشتر

مطالعه جامع شیوع پاروویروس سگ‌سانان (‏CPV‏) در ایران و مقایسه فیلوژنتیکی ناحیه ژن ‏VP2‎‏ ‏سویه‌های غالب ایرانی با سایر سویه‌های شایع

رضا فرجی؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ مصطفی صادقی؛ رضا میرایی آشتیانی؛ حمید رضا مژگانی

دوره 52، شماره 1 ، خرداد 1400، ، صفحه 11-21

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2020.308036.653795

چکیده
  یکی از اصلی­ترین چالش­هایی که این روزها گله‌داران، صاحبان سگ­ها و یا مراکز آموزش و پرورش سگ­های کار را تهدید می­کند مربوط به بیماری­ پاروویروس (CPV) سگ­سانان است. این ویروس در طی سال‌ها از زمان شناسایی تا کنون به انواع و سویه‌های متعددی انشقاق یافته که در نتیجه تغییرات ژنتیکی و آمینو اسیدی، تابع آن بوده و موجب شده طیف وسیعی ...  بیشتر

اثر استفاده از اطلاعات ژنومی گاوهای ماده در جمعیت مرجع، روی صحت ارزش‌های اصلاحی ‏ژنومی برآوردشده در گاوهای هلشتاین ایران

محمد رضا منصوریان؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ مهدی سرگلزائی

دوره 51، شماره 4 ، اسفند 1399، ، صفحه 299-311

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2021.314919.653811

چکیده
  ارزیابی‌های دقیق ژنومی به یک جمعیت مرجع بزرگ با اطلاعات عملکردی قابل اعتماد (مانند ارزش‌های اصلاحی پیش‌بینی‌شده) بستگی دارد. هدف از این مطالعه، شناسایی مناسب‌ترین جمعیت مرجع برای پیش‌بینی ارزش اصلاحی ژنومی حیوانات در برنامه‌های اصلاح‌نژاد گاو شیری هلشتاین ایران می‌باشد. ابتدا با استفاده از شبیه‌سازی ژنوم و مطابق با روند اصلاح‌نژاد ...  بیشتر

بررسی کارایی استراتژی‌های به‌کاررفته برای کنترل بیماری ‏BVD‏ در نژاد هلشتاین

مونا خلقی؛ محمد مرادی شهربابک؛ مصطفی صادقی؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ محمد مهدی رنجبر؛ محسن لطفی

دوره 51، شماره 2 ، مرداد 1399، ، صفحه 163-171

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2020.293619.653757

چکیده
  این پژوهش به‌منظور بررسی شیوع اسهال ویروسی گاوان (BVD) و نحوه عملکرد اقدامات صورت‌گرفته در جهت کنترل این بیماری طی 50 سال اخیر در برخی از استان‌های کشور جهت مبارزه با این بیماری انجام شد. بدین منظور، از 500 رأس گاو هلشتاین متعلق به سه گاوداری صنعتی بسیار موفق در سه استان تهران، اصفهان و قزوین به‌صورت تصادفی نمونه خون تهیه و با تکنیک الایزا ...  بیشتر

شناسایی ژن‌های مؤثر بر میزان چربی محوطۀ بطنی جوجه‏‌‏های گوشتی با استفاده از داده‌های ‏ریزآرایه و توالی‌یابی ‏RNA

فرزاد غفوری؛ مصطفی صادقی؛ ابوالفضل بهرامی؛ سید رضا میرائی آشتیانی

دوره 50، شماره 4 ، اسفند 1398، ، صفحه 259-269

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2019.281245.653703

چکیده
  امروزه انتخاب ژنتیکی برای افزایش رشد و تولید پروتئین حیوانی با کیفیت بالا در جوجه‏‌‏های گوشتی (Gallus gallus domesticus)، معمولاً منجر به افزایش وزن بیش از حد خواهد شد که نتیجۀ آن تأثیر منفی بر راندمان مصرف خوراک و کیفیت لاشه مانند افزایش چربی محوطه بطنی می­شود. هدف این مطالعه استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت چربی دو دسته جوجه‏‌‏های ...  بیشتر

بیان افتراقی ژن گاوهای بوس تاروس (هلشتاین) و بوس ایندیکوس (کلیستانی) با استفاده از داده های RNA-Seq

مینا سلیم پور؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ محمد حسین بنابازی

دوره 50، شماره 1 ، خرداد 1398، ، صفحه 47-55

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.246004.653585

چکیده
  این پژوهش با هدف تعیین مقایسه افتراقی پروفایل بیان ژن در دو زیرگونه گاو بوس تاروس (هلشتاین) و بوس ایندیکوس (کلیستانی) انجام شد. برای این منظور، ترانسکریپتوم نمونه­ای از هریک از جمعیت­های گاو ماده هلشتاین آمریکا و گاو ماده کلیستانی پاکستان از طریق همردیفی و مکان­یابی خوانش­های کوتاه mRNA تشکیل شد. این خوانش­ها قبلاً با استفاده ...  بیشتر

بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت گاومیش‌های‌ آذری با استفاده از نشانگر‌های ریزماهواره

مهدیه یوسفی دارستانی؛ سیدرضا میرائی آشتیانی؛ مصطفی صادقی

دوره 49، شماره 3 ، آذر 1397، ، صفحه 355-360

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.43867.653150

چکیده
  با توجه به اهمیت حفظ تنوع در نژادهای بومی و شناسایی ذخایر ژنتیکی کشور، تنوع ژنتیکی جمعیت گاومیش­ آذری با استفاده از ده نشانگر ریزماهواره­ای (BoLA-DRB3، BM1818، BM1824، CSSM033، CSSM047، ILSTS017، ILSTS033، ILSTS058، ILSTS061 و ILSTS089) بررسی شد. شمار 70 نمونه مو از گاومیش­های آذری در سه منطقۀ شمال­غربی کشور (استان­های اردبیل، آذربایجان­شرقی و آذربایجان­غربی) ...  بیشتر

پروفایل ترانسکریپتوم یاخته‌های گرانولوزای تخمدان گاو در مراحل مختلف فولیکولوژنسیز

ابوالفضل بهرامی؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ مصطفی صادقی؛ علی نجفی

دوره 48، شماره 3 ، آذر 1396، ، صفحه 463-471

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.227145.653508

چکیده
  آخرین مرحلۀ فولیکولوژنسیز در فولیکول تخمدان پستانداران شامل بیشترین توسعه و اوج فعالیت لایه­های بافت پوششی (اپیتلیال) یاخته­های گرانولوزا است که حفرۀ آنترال را احاطه کرده­اند. در طول رشد و توسعۀ فولیکول، یاخته­های گرانولوزا تکثیر می­شوند و هورمون­های لازم برای رشد اووسیت را ترشح می­کنند. در گاو، فولیکول نیاز به رشد ...  بیشتر

برآورد فراسنجه‌های ژنتیکی صفات کیفی تخم‌مرغ‌های بومی مازندران

هما سلیمانی؛ رسول واعظ ترشیزی؛ مرادپاشا اسکندری نسب؛ سید رضا میرایی آشتیانی؛ محمد حسین شهیر

دوره 48، شماره 1 ، خرداد 1396، ، صفحه 61-67

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2017.34200.653097

چکیده
  در این بررسی از اطلاعات مربوط به 37300 رکورد وزن تخم‌مرغ و 1540 رکورد وزن سفیده، وزن زرده، وزن پوسته، استحکام پوسته، ضخامت پوسته و واحد هاو مرغ‌های بومی مازندران برای برآورد فراسنجه‌های ژنتیکی ویژگی‌های کیفی تخم‌مرغ استفاده شد. رکوردهای وزن تخم‌مرغ در طی سال‌های 1371 تا 1385 و دیگر رکوردها در سال 1385 از تخم‌مرغ‌های 3 روز متوالی 769 مرغ گرد‌آوری‌شده ...  بیشتر

همراهی همردیف‌های ژن BoLA-DRB3 با افزایش یاخته‌های تک‌هسته‌ای خون محیطی در پاسخ به استافیلوکوکوس آرئوس

هادی آتشی؛ محمد مرادی شهربابک؛ حسن مهربانی یگانه؛ سید رضا میرایی آشتیانی؛ قدرت الله رحیمی میانجی

دوره 47، شماره 3 ، آذر 1395، ، صفحه 369-378

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2016.59792

چکیده
  هدف این پژوهش، بررسی همراهی همردیف (آلل)­های ژن BoLA-DRB3 با افزایش یاخته­های تک­هسته­ای خون محیطی در پاسخ به استافیلوکوکوس آرئوس بود. حیوانات موردبررسی (347 حیوان) شامل 155 گوسالۀ آمیختۀ هلشتاین-شاروله، 60 گوسالۀ ناشی از آمیزش حیوانات نر هلشتاین- شاروله با حیوانات مادۀ هلشتاین، 46 گوسالۀ ناشی از آمیزش حیوانات مادۀ هلشتاین- شاروله با ...  بیشتر

چندشکلی ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز 1 (DGAT1) در جمعیت گاومیش‌های ایران

معصومه ناصرخیل؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ مصطفی صادقی؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ دکهوان لی

دوره 47، شماره 2 ، شهریور 1395، ، صفحه 175-183

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2016.59022

چکیده
  دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز1 (DGAT1) آنزیم کلیدی در ساخت (سنتز) تری گلیسیرید است. ایجاد یک جهش جایگزینی باعث تبدیل گوانین به آدنین و منجر به جایگزینی لیزین با آلانین در آنزیم می­شود که در گاو تأثیری بزرگ بر شیر و ترکیب‌های آن دارد. در این تحقیق، چندشکلی در ناحیۀ اگزون 3 تا اگزون 17 ژن DGAT1 در سه تودۀ بومی گاومیش­های ایران بررسی شد. استخراج ...  بیشتر

تعیین ویژگی توالی و تنوع ژن هورمون رشد در شترهای دوکوهانه و یک‌کوهانۀ ایران

نعمت هدایت ایوریق؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ محمد مرادی شهر بابک؛ صابر محمد مقصودی

دوره 46، شماره 4 ، دی 1394، ، صفحه 399-406

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2015.56825

چکیده
  شتر گونه‌ای بسیار مقاوم در برابر خشکی است که در سخت‌ترین شرایط آب‌وهوایی، محصولاتی مانند شیر و گوشت تولید می‌کند. با توجه به اینکه تعداد شترهای ایران در حال کاهش است، برای حفظ و بهبود تولیدات این ‌گونه، مطالعات کاربردی ژنتیکی ضروری است. یکی از جایگاه‌های مهمی که اثر آن در سایر گونه‌ها روی صفات اقتصادی مشخص شده، جایگاه ژن کدکنندۀ ...  بیشتر

بررسی ساختارهای جوامع و خرده جوامع دامی به روش خوشه‌بندی شبکه‌ای بدون نظارت با استفاده از نشانگرهای ژنتیکی متراکم

جواد رحمانی نیا؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ حسین مرادی شهربابک

دوره 46، شماره 3 ، مهر 1394، ، صفحه 277-287

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2015.56422

چکیده
  رشد روزافزون اطلاعات حاصل از تعیین ژنوتیپ نمونه‌ها به‌ویژه با استفاده از توالی‌یابی چندشکلی‌های تک‌نوکلئوتیدی (SNP) سبب تحول در تجزیه‌وتحلیل دقیق ساختار جوامع در گونه‌های مختلف شده است. تاکنون از روش‌های مختلفی برای بررسی ساختار جمعیتی با استفاده از نشانگرهای موجود در کل ژنوم استفاده شده است که هرکدام نقاط ضعف و قوتی دارند. در ...  بیشتر

بررسی حساسیت ژنتیکی گاوهای بومی و هلشتاین ایران به جنون گاوی

صابر محمد مقصودی؛ سید رضا میرائی آشتیانی؛ حسن مهربانی یگانه؛ محمد حسین بنابازی

دوره 45، شماره 2 ، مرداد 1393، ، صفحه 89-97

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2014.51811

چکیده
  در مطالعات سال‌های اخیر، ارتباط بین چندشکلی ناحیۀ پروموتور (حذف و درج 23 جفت بازی) و اینترون 1 (حذف و درج 12 جفت بازی) ژن PRNP (ژن کدکنندۀ پروتئین پریون) و حساسیت به جنون گاوی اثبات شده است. درج این جایگاه‏ها مقاومت به جنون گاوی کلاسیک را در گاوها افزایش می‏دهد، در حالی‌که حذف این جایگاه‏ها باعث حساسیت بیشتر به جنون گاوی می‏شود. در ...  بیشتر

تعیین برخی عوامل مؤثر بر نرخ خطای ایمپیوتیشن ژنوتیپی برای استفاده در مطالعات رابطه‌یابی سراسری ژنومی در گاوهای شیری

محمد صاحب هنر؛ محمد مرادی شهربابک؛ سید رضا میرایی آشتیانی؛ عباس پاکدل؛ دورین جی. گریک

دوره 45، شماره 1 ، اردیبهشت 1393، ، صفحه 9-15

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2014.51744

چکیده
  در این مطالعه اثر دو راهبرد متفاوت، تأثیر رابطۀ خویشاوندی بین جمعیت مرجع و جمعیت‌های آزمون، و اثر فراوانی آلل نادر بر نرخ خطای ایمپیوتیشن با استفاده از جمعیتی شبیه‌سازی‌شده، بررسی شد. جمعیت مرجع حاوی 1000 فرد و جمعیت‌های آزمون حاوی 500 فرد بود. ژنوتیپ افراد در جمعیت مرجع با دو تراشه تعیین شد. تراشۀ اول تراشه‌ای متراکم حاوی 75000 SNP به ...  بیشتر

رابطه ی اسیدهای آمینه جایگاه اتصال پپتیدی ملکول BoLA-DR با ازدیاد سلول های تک هسته ای خون محیطی در پاسخ به استافیلوکوکوسآرئوس

هادی آتشی؛ محمد مرادی شهربابک؛ حسن مهربانی یگانه؛ سید رضا میرایی آشتیانی؛ قدرت اله رحیمی میانجی

دوره 44، شماره 3 ، آذر 1392، ، صفحه 247-254

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2013.36152

چکیده
  در این تحقیق، رابطه¬یبین اسیدهای آمینه جایگاه اتصال پپتیدی ملکول BoLA-DR با ازدیاد سلول¬های تک¬هسته¬ای خون محیطی در پاسخ به استافیلوکوکوس آرئوس و فایتوهماگلوتنین بررسی شد. واحدهای آزمایشی شامل 86 گوساله¬ی هلشتاین، 155 گوساله¬ی دورگ (F2) هلشتاین و شاروله، 60 گوساله¬ی (R1)حاصل از آمیزش حیوانات نر هلشتاین- شاروله با حیوانات ماده ...  بیشتر