آرزو شهسواری؛ محمد رزم کبیر؛ امیر رشیدی
چکیده
هدف از پژوهش کنونی ارزیابی ژنتیکی سخت‌زایی گاوهای هلشتاین با مدلهای خطی، خطی تصحیح شده و آستانهای بود. اطلاعات شامل رکوردهای ویرایش شده 133876 راس گاو مربوط به هشت گله از گلههای گاو هلشتاین اصفهان بود که طی سالهای 1384 تا 1397 توسط تعاونی وحدت جمعآوری شده بودند. اثر عوامل ثابت موجود در مدل شامل گله، سال-فصل زایش، جنسیت گوساله ...
بیشتر
هدف از پژوهش کنونی ارزیابی ژنتیکی سخت‌زایی گاوهای هلشتاین با مدلهای خطی، خطی تصحیح شده و آستانهای بود. اطلاعات شامل رکوردهای ویرایش شده 133876 راس گاو مربوط به هشت گله از گلههای گاو هلشتاین اصفهان بود که طی سالهای 1384 تا 1397 توسط تعاونی وحدت جمعآوری شده بودند. اثر عوامل ثابت موجود در مدل شامل گله، سال-فصل زایش، جنسیت گوساله و سن اولین زایش و آثار تصادفی شامل پدر گاو و پدر گوساله و محیط دائم مادر بود. ویرایش رکوردها و کنترل کیفیت داده‌ها با نرم‌افزار SAS و ارزیابی ژنتیکی حیوانات با مدلهای مورد مطالعه به کمک نرم‌افزار DMU انجام شد. نتایج نشان داد که گله و سال-فصل زایش، جنسیت گوساله و سن اولین زایش بر نرخ وقوع سخت‌زایی تأثیر داشتند. وراثتپذیری مستقیم سخت‌زایی در تلیسهها و گاوها با مدل خطی به‌ترتیب 10/0 و 07/0 و با مدل آستانهای به‌ترتیب 13/0 و 10/0 برآورد شد. وراثتپذیری برآورد شده با مدل خطی پس از تصحیح و تبدیل به مقیاس زمینهای در تلیسهها به 19/0 و در گاوها به 14/0 افزایش یافت. همبستگی ژنتیکی بین اثر مستقیم و مادری در مدلهای آستانهای و خطی برای تلیسهها و گاوها 56/0- تا 74/0- برآورد شد. به دلیل همبستگیهای رتبهای متفاوت، رتبه بندی حیوانات براساس ارزش اصلاحی پیشبینی‌شده با مدلهای خطی و آستانهای متفاوت بود. معیار آکایک محاسبه‌شده برای مدل آستانهای از مدل خطی کمتر بود و بنابراین در پیشبینی ارزش اصلاحی حیوانات مدل آستانهای نسبت به مدل خطی برتری دارد و این مدل برای ارزیابی ژنتیکی سخت‌زایی پیشنهاد می‌شود.
بابک عنایتی؛ امیر رشیدی؛ رستم عبداللهی آرپناهی؛ محمد رزم کبیر
چکیده
هدف از پژوهش کنونی مقایسه استراتژی‌های اصلاح نژاد در گله مرغ بومی مازندران به کمک شبیهسازی رایانه‌ای بود. صفات شبیه‌سازیشده، وزن بدن در زمان تولد (BW1)، هشت هفتگی (BW8)، دوازده هفتگی (BW12)، زمان بلوغ جنسی (BWM)، سن بلوغ جنسی (AFE)، وزن اولین تخم (EWM)، میانگین وزن تخممرغ در هفتههای 28 تا 32 (EW28-32) و تعداد تخممرغ (EN) بودند. در استراتژی ...
بیشتر
هدف از پژوهش کنونی مقایسه استراتژی‌های اصلاح نژاد در گله مرغ بومی مازندران به کمک شبیهسازی رایانه‌ای بود. صفات شبیه‌سازیشده، وزن بدن در زمان تولد (BW1)، هشت هفتگی (BW8)، دوازده هفتگی (BW12)، زمان بلوغ جنسی (BWM)، سن بلوغ جنسی (AFE)، وزن اولین تخم (EWM)، میانگین وزن تخممرغ در هفتههای 28 تا 32 (EW28-32) و تعداد تخممرغ (EN) بودند. در استراتژی اول خروسها بر اساس ارزش اصلاحی صفت BW12 و مرغها براساس یک شاخص چهار صفتی شامل BW12، AFE، EW28-32 و EN انتخاب شدند. در استراتژی دوم خروسها و مرغها براساس یک شاخص چهار صفتی شامل BW12، AFE، EW28-32 و EN انتخاب شدند. در استراتژی اول پس از 10 نسل صفات BW1، BW12، BWM، EW28-32 و EWM به ترتیب به میزان 49/1، 81/573، 58/397، 96/3 و 75/3 گرم و AFE وEN به ترتیب به میزان 51/3- روز و 09/2 تخممرغ بهبود یافت. در استراتژی دوم پس از 10 نسل بهبود صفاتBW12 ،BWM ، AFE و EN به میزان 78/415 و 74/218 گرم و 77/9- روز و 45/9 تخممرغ بود. میانگینهای ضریب همخونی در استراتژی اول و دوم در پایان نسل دهم به ترتیب برابر 048/0 و 078/0 بود. نتایج حاصل نشان داد، استراتژی اول برای گلههای مادر با هدف تولید گوشت و استراتژی دوم برای گلههای دو منظوره با هدف تولید تخممرغ و گوشت مناسب میباشد.
امین مرتضوی؛ امیر رشیدی؛ مصطفی قادری-زفره‌ئی؛ پرهام مرادی؛ محمد رزم کبیر
چکیده
هدف از این پژوهش، شناسایی ژن‌ها و کاوشگرهای هاب ناشی از ایجاد شبکه‌های بیزی در دادههای بیان ژن و کاوشگری در بافت‌های مختلف گونۀ گاو با استفاده از دادههای ریزآرایۀ DNA بود. با استفاده از دادههای خام بیان ژن و کاوشگری در هر بافت، ژن‌ها و کاوشگرهایی که عامل بیشترین میزان واریانس بیان ژن بودند، شناسایی‌شده و سپس شبکۀ بیزی، ...
بیشتر
هدف از این پژوهش، شناسایی ژن‌ها و کاوشگرهای هاب ناشی از ایجاد شبکه‌های بیزی در دادههای بیان ژن و کاوشگری در بافت‌های مختلف گونۀ گاو با استفاده از دادههای ریزآرایۀ DNA بود. با استفاده از دادههای خام بیان ژن و کاوشگری در هر بافت، ژن‌ها و کاوشگرهایی که عامل بیشترین میزان واریانس بیان ژن بودند، شناسایی‌شده و سپس شبکۀ بیزی، برای آنها برازش داده شد. ژن‌ها و کاوشگرهای هاب با استفاده از نسبت فراسنجه‌های درجۀ درون و بیرون شناسایی شدند. اندازۀ پوشش مارکفی در شبکه‌های مختلف متفاوت بود که بهاحتمال بیانگر وجود زیرساختارهای ساختارشناختی (توپولوژیکی) برای شبکه‌های یادشده در بافت‌های مختلف است. در روش شبکۀ ژن محور، در بافت ماهیچۀCBR1 ،LOC788826 ، در بافت پستانیNID2 ، COL5A2، LOC616942،FXYD3 ، در بافت کبدی LOC100132279،MGC127133 ، MBOAT2،CLDN2 ، ANKRD1، در بافت رحم IGFBP1، DGAT2، CKMT1، ISG15، CKMT1 و در بافت تخمدانLOC286871 وINHBA بهعنوان ژنهای هاب شناسایی شدند. همچنین در روش ایجاد شبکۀ کاوشگر محور، مشخص شد که دو ژن JSP.1 و BOLA-DQB در بافت‌های کبد و رحم فعال هستند. ولی این ژن‌ها در روش ژن محور در ایجاد شبکۀ ژنی بهعنوان ژن هاب استخراج نشدند.
جمال فیاضی؛ عمران رستمی؛ امیر رشیدی
چکیده
در این پژوهش توارث سیتوپلاسمی وزن بیدۀ یک‌سالگی در بز نژاد مرخز با استفاده از روش آماری بیزی بررسی شد. برای برآورد فراسنجه (پارامتر)های ژنتیکی از رکوردهای گردآوری‌شده در سالهای 1390-1371 در ایستگاه پژوهشی اصلاح نژاد بز مرخز در سنندج استفاده شد. برای بررسی اثر عامل‌های محیطی بر دادههای این صفت از رویۀ GLM نرم‌افزار آماری SAS و برای برآورد ...
بیشتر
در این پژوهش توارث سیتوپلاسمی وزن بیدۀ یک‌سالگی در بز نژاد مرخز با استفاده از روش آماری بیزی بررسی شد. برای برآورد فراسنجه (پارامتر)های ژنتیکی از رکوردهای گردآوری‌شده در سالهای 1390-1371 در ایستگاه پژوهشی اصلاح نژاد بز مرخز در سنندج استفاده شد. برای بررسی اثر عامل‌های محیطی بر دادههای این صفت از رویۀ GLM نرم‌افزار آماری SAS و برای برآورد فراسنجه‌های ژنتیکی از نرم‌افزار Gibbs1f90، بر پایۀ مدل دام از رویۀ نمونه‌گیری گیبس، استفاده شد. عامل‌هایی مانند سال تولد، جنس و سن مادر بهعنوان اثر ثابت و سن دام و وزن بدن در هنگام رکورد برداری بهعنوان متغیرهای کمکی در مدل گنجانده شدند. بنابر نتایج به‌دست‌آمده از این پژوهش، بهترین مدل انتخاب‌شده برای صفت وزن بیده، مدل دربرگیرندۀ اثر ژنتیکی افزایشی مستقیم، ژنتیکی افزایشی مادری، محیط دائمی مادری و اثر ژنتیکی سیتوپلاسمی با در نظر گرفتن کوواریانس بین اثر ژنتیکی افزایشی مستقیم و مادری بود. درصد واریانس ژنتیکی افزایشی مستقیم، ژنتیکی افزایشی مادری، محیط دائمی مادری و ژنتیکی سیتوپلاسمی به ترتیب 27/19، 6/6، 03/3 و 82/1 از کل واریانس برآورد شد. نقش اثر سیتوپلاسمی با توجه به معنیدار بودن برای ورود به مدل از یک‌سو و کم بودن میزان واریانس آن از سوی دیگر، بهعنوان تصحیحکننده اهمیت دارد، ولی نمیتواند بهعنوان معیار انتخاب لحاظ شود.
محمد رزم کبیر؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ محمد مرادی شهر بابک؛ امیر رشیدی؛ محمد باقر صیاد نژاد
دوره 40، شماره 1 ، خرداد 1388
چکیده
در این پژوهش، برای برآورد روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدی جمعیت گاوهای هلشتاین ایران از اطلاعات موجود در مرکز اصلاح نژاد دام کشور که در طی سالهای 1366 تا 1383 تهیه شده بود، استفاده شد. برآورد مؤلفه‌های (کو)واریانس و پارامترهای ژنتیکی با استفاده از رکوردهای دوره شیردهی اول و روش حداکثر درست نمایی محدود شده با الگوریتم AIREML صورت گرفت. ...
بیشتر
در این پژوهش، برای برآورد روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدی جمعیت گاوهای هلشتاین ایران از اطلاعات موجود در مرکز اصلاح نژاد دام کشور که در طی سالهای 1366 تا 1383 تهیه شده بود، استفاده شد. برآورد مؤلفه‌های (کو)واریانس و پارامترهای ژنتیکی با استفاده از رکوردهای دوره شیردهی اول و روش حداکثر درست نمایی محدود شده با الگوریتم AIREML صورت گرفت. ارزیابی ژنتیکی و پیش بینی ارزشهای اصلاحی حیوانات با استفاده از مدل حیوانی چند متغیره انجام شد. به منظور برآورد مولفههای (کو)واریانس و ارزیابی ژنتیکی از نرم افزار MATVEC استفاده شد. وراثت پذیری تولید شیر، مقدار چربی و مقدار پروتئین به ترتیب 27/0، 22/0 و 25/0 برآورد شد. روند ژنتیکی به صورت تابعیت خطی بهترین پیش بینی نااریب خطی (BLUP)ارزشهای اصلاحی حیوانات بر سال تولد برآورد گردید. روند ژنتیکی تولید شیر 10/2±84/33 کیلوگرم، برای مقدار چربی 05/0±64/0 کیلوگرم و برای مقدار پروتئین 08/0±00/1 کیلوگرم برآورد شد)01/0 P
مرتضی ستایی مختاری؛ امیر رشیدی؛ محمدرضا محمد آبادی؛ حسین مرادی شهر بابک
دوره 40، شماره 1 ، خرداد 1388
چکیده
در این پژوهش از دادههای 2332 بره حاصل از 815 میش و 61 قوچ که در طی سالهای 1372 تا 1383 در ایستگاه اصلاح نژاد گوسفند کرمانی جمع آوری شده بود، برای برآورد روند فنوتیپی، ژنتیکی و محیطی وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی استفاده شد. وراثت پذیری صفات در تجزیه تک صفتی با استفاده از روش حداکثر درستنمایی محدود شده بی نیاز از مشتق‌گیری ...
بیشتر
در این پژوهش از دادههای 2332 بره حاصل از 815 میش و 61 قوچ که در طی سالهای 1372 تا 1383 در ایستگاه اصلاح نژاد گوسفند کرمانی جمع آوری شده بود، برای برآورد روند فنوتیپی، ژنتیکی و محیطی وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی استفاده شد. وراثت پذیری صفات در تجزیه تک صفتی با استفاده از روش حداکثر درستنمایی محدود شده بی نیاز از مشتق‌گیری و برازش شش مدل حیوانی مختلف با افزودن و حذف آثار ژنتیکی افزایشی مادری و محیطی دائمی مادری، برآورد شدند. آزمون نسبت درستنمایی نشان داد که مدل دارای آثار ژنتیکی مستقیم و ژنتیکی افزایشی مادری، بدون در نظر گرفتن کوواریانس بین آنها، برای وزن تولد، مدل دارای آثار ژنتیکی مستقیم و محیطی دائمی مادری برای وزن‌های شیرگیری، شش ماهگی و نه ماهگی و مدل دارای آثار ژنتیکی مستقیم برای وزن یک سالگی مناسب بودند. همبستگی های فنوتیپی، ژنتیکی و محیطی با تجزیه چند صفتی و با مدل مناسب برای هر صفت برآورد شدند. ارزش های اصلاحی با استفاده از مدل حیوانی مناسب هر صفت با تجزیه تک صفتی و چند صفتی برآورد گردیدند. روند ژنتیکی، فنوتیپی و محیطی به ترتیب از تابعیت میانگین ارزش اصلاحی، میانگین فنوتیپی و تفاوت میانگین ارزش اصلاحی از میانگین فنوتیپی بر سال تولد محاسبه شدند. روند ژنتیکی مستقیم برای صفات وزن تولد، شیرگیری، شش ماهگی، نه ماهگی و یک سالگی در تجزیه تک صفتی و چند صفتی به ترتیب 30/0±53/0 و 14/1±84/0، 27/18±41/96 و 41/37±29/101، 11/26±24/88 و 34/48±51/90، 68/10±35/24 و 49/11±76/29، 43/10±53/31 و 58/12± 18/35 گرم در سال بود. روند ژنتیکی افزایشی مادری وزن تولد در تجزیه تک صفتی و چند صفتی به ترتیب 21/1±07/3 و 67/1±91/2 گرم در سال برآورد گردید.
