8954856055505db

تعیین جنسیت قناری بر پایۀ ژن CHD مربوط به کروموزوم‌های جنسی با استفاده از پر

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

2 دانشیار و استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

3 استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

چکیده

 هدف از این تحقیق استفاده از پر به­عنوان روشی ساده، سریع، کم­هزینه، بدون خطر و ایمن و مطمئن برای تعیین جنسیت قناری در اوایل تولد، برای کمک به برنامه‌های اصلاح نژادی و پرورش این پرنده است. شکل ظاهری جنس نر و مادۀ بسیاری از پرندگان از جمله قناری تا حدودی همانند هم بوده و تشخیص جنسیت آن‌ها بسیار دشوار است. با استفاده از این روش مولکولی بر پایۀ اختلاف طول ژن Chromo-helicase-DNA(CHD) در کروموزوم­های جنسی Z و W و با به­کارگیری روش PCR می­توان در بدو تولد جنسیت پرنده را تشخیص داد. در این بررسی از خون و پر140 قطعه قناری از ده نژاد مختلف نمونه‌گیری و استخراج DNA انجام شد. لازم به یادآوری است در آغاز پنج جفت آغازگر برای انجام PCR طراحی و درنهایت یک جفت آغازگر اختصاصی بر پایۀ دقت تشخیص جنسیت تأیید و استفاده شد. نتایج نشان­دهندۀ افزونش قطعۀ  DNAبه طول 252 جفت باز در جنس نر (ZZ) و دو قطعه به طول­های 252 و 309 جفت باز (تفاوت 57 جفت بازی) در جنس ماده (ZW)  بود. توالی­یابی DNA این دو قطعه انجام شد و برای نخستین بار توالی این دو قطعه از ژن CHD در گونۀ قناری به نام­های CHDZ-1 و CHDW-1 با شماره‌های شناسایی MG679825.1 و MG679826.1 در سایت NCBI ثبت شد. با توجه به نتایج، می­توان از این روش، که برای نخستین بار با استفاده از توالیDNA  ژن CHD قناری به دست آمد به‌عنوان روشی کاربردی و مطمئن برای تعیین جنسیت قناری استفاده کرد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Sex determination in the canary based on the CHD gene located at the sex chromosome using feather

نویسندگان [English]

  • Hamidreza Abdollahi 1
  • Hassan Mehrabani Yeganheh 2
  • Hossein Moradi Shahrbabak 3
1 Former M. Sc. Student, College of Agriculture & Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
2 Associat Professor, College of Agriculture & Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
3 Assistant Professor, College of Agriculture & Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
چکیده [English]

The aim of this research was to utilize a simple, rapid, cheap and safe method for sex determination of newly born canaries through feather to help accurately breeding this bird. The external morphology of males and females of many birds such as canary are fairly similar to each other, Therefore, determining their sexes is very difficult. The different length of CHD (chromo-helicase-DNA-binding) gene in Z and W chromosomes can recignized by using molecular technique based and PCR method, for the sex determination of young birds. In this study, blood and feathers samples of 140 canaries from 10 different breeds were used and their DNA were extracted. It should be mentioned that for PCR, at first 5 primers designed and finally 1 specific primer were confirmed and used. The results showed that the amplification of a fragment with the length of 252 bp for males (ZZ) and two fragments with the lengths of 252 and 309 bp for female (ZW). The bands had a length difference of 57 bp. The DNA sequencing of these two fragments was done for the first time, the sequence of these two fragments of the CHD gene in canary species was submitted and accepted in the NCBI site under the names of CHDZ-1 and CHDW-1 with the accession numbers of MG679825.1 and MG679826.1.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Canary
  • CHD gene
  • molecular technique
  • PCR
  • sex determination
  1. Ahsani, M. R., Bafti, M. S., Esmailizadeh, A. K. & Mohammadabadi, M. R. (2011). Genotyping of isolates of Clostridium perfringens from vaccinated and unvaccinated sheep. Small Ruminant Research, 95(1), 65-69.
  2. Ahsani, M. R., Mohammadabadi, M. R. & Shamsaddini, M. B. (2010). Clostridium perfringens isolate typing by multiplex PCR. Journal of Venomous Animals and Toxins including Tropical Diseases, 16(4), 573-578.
  3. Centeno-Cuadros, A., Abbasi, I. & Nathan, R. (2017). Sex Determination in the Wild: A Field Application of Loop-Mediated Isothermal Amplification Successfully Determines Sex across Three Raptor Species. Molecular Ecology Resources, 17(2), 153-60
  4. Cerit, H. & Avanus, K. (2008). Sex determination by CHDW and CHDZ genes of avian sex chromosomes in Nymphicus hollandicus. Turkish Journal of Veterinary and Animal Sciences, 31(6), 371-374.
  5. Ciorpac, M., Druica, R. C., Ghiorghita, G., Cojocaru, D. & GORGAN, D. L. (2016). CHD genes: a reliable marker for bird populations and phylogenetic analysis? Case study of the superfamily Sylvioidea (Aves: Passeriformes). Turkish Journal of Zoology, 40(5), 749-757.
  6. Doosti, A., Fathpour, H. & Moshkelani, S. (2009). Sex Identification in the Canary Using DNA Typing Methods. Bjvm, 12(3), 207-11.
  7. Fridolfsson, A. K. & Ellegren, H. (1999). A simple and universal method for molecular sexing of non-ratite birds.  Journal of Avian Biology, 116-121.
  8. Gábor, M., Miluchová, M., Trakovická, A., Hrnčár, C. & Radosová, E. (2014). Sex determination of superorder Neognathae (class Aves) by molecular genetics methods. Scientific Papers Animal Science and Biotechnologies, 47(1), 69-72.
  9. Griffiths, R., Double, M. C., Orr, K. & Dawson, R. J. (1998). A DNA test to sex most birds.” Molecular Ecology, 7(8), 1071-1075.
  10. Khaerunnisa, I., Sari, E., Ulfah, M. & Sumantri, C. (2013). Avian Sex Determination Based on Chromo Helicase DNA-binding (CHD) Genes Using Polymerase Chain Reaction (PCR). Media Peternakan, 36(2), 85.
  11. Koch, R. E. & Hill, G. E. (2015). Rapid evolution of bright monochromatism in the domestic Atlantic Canary (Serinus canaria). The Wilson Journal of Ornithology, 127(4), 615-621.
  12. Law, J. W. F., Ab Mutalib, N. S., Chan, K. G. & Lee, L. H. (2015). Rapid methods for the detection of foodborne bacterial pathogens: principles, applications, advantages and limitations. Frontiers in Microbiology, 5, 770.
  13. Moghaddas, E. (2011). Breeding, maintenance and canary diseases.  Nilouberg Publishing. (in Farsi)
  14. Nanda, I., Shan, Z., Schartl, M., Burt, D. W., Koehler, M., Nothwang, H. G., ... & Engel, W. (1999). 300 million years of conserved synteny between chicken Z and human chromosome 9. Nature Genetics, 21(3), 258-259.
  15. Sangster, G et al. (2016). Taxonomic Recommendations for Western Palearctic Birds: 11th Report. Ibis, 158(1), 206-12.
  16. Shizuka, D. & Lyon, B. E. (2008). Improving the reliability of molecular sexing of birds using a W‐specific marker. Molecular Ecology Resources, 8(6), 1249-1253.
  17. Truett, G. E., Walker, J. A. & Baker, D. G. (2000). Eradication of infection with Helicobacter spp. by use of neonatal transfer. Comparative Medicine, 50(4), 444-451.
  18. Vucicevic, M., Stevanov‐Pavlovic, M., Stevanovic, J., Bosnjak, J., Gajic, B., Aleksic, N. & Stanimirovic, Z. (2013). Sex determination in 58 bird species and evaluation of CHD gene as a universal molecular marker in bird sexing. Zoo Biology, 32(3), 269-276.
  19. Włodarczyk, R., Minias, P., Gogga, P., Kaczmarek, K., Remisiewicz, M. & Janiszewski, T. (2011). Sexing Common Snipe Gallinago gallinago in the field using biometric criteria. Wader Study Group Bull, 118(1), 10-13.