8954856055505db

مقایسه صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی و رایج با استفاده از تجزیه دوصفتی و تک صفتی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری دانشگاه تهران

2 استادیار دانشگاه تهران

3 دانشگاه تهران- دکتری

چکیده

به منظور مقایسه صحت برآورد تجزیه های تک صفتی و چندصفتی ژنومی و رایج تعداد 100 حیوان غیرخویشاوند برای50 نسل، جهت ایجاد عدم تعادل پیوستگی بین جایگاه ها آمیزش تصادفی داشتند. برای هر حیوان ژنومی با طول 10مورگان و تعداد 10 کروموزوم با طول یکسان 1 مورگان، شبیه سازی شد. نشانگرهای SNP در فواصل مساوی بر روی هر کروموزوم قرار گرفتند و QTLها بصورت تصادفی روی ژنوم پخش شدند. تجزیه های تک صفتی و چند صفتی برای پیش بینی اثر نشانگرها استفاده و ارزش های اصلاحی افراد از مجموع اثرات نشانگرها با توجه به ژنوتیپ آنها محاسبه شد. نتایج حاصل نشان داد که صحت ارزش های اصلاحی ژنومی درهمه حالات به میزان قابل ملاحظه ای بالاتر از روش رایج بود و از 41/0 برای صفت با توارث پذیری 1/0تا 81/0 برای صفت با توارث پذیری 5/0 متغیر بود در حالی که برای روش رایج صحت براوردها بین 21/0 تا 53/0 بود. افزایش تراکم نشانگرها، توارث پذیری صفات و تعداد افراد جمعیت مرجع باعث افزایش صحت ارزیابی ها شد. صحت ارزش های اصلاحی چند صفتی در حالت همبستگی بالای بین صفات برای صفت با توارث پذیری پایین بالاتر بود (p<0.0001).

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Comparison of the Accuracy of the Estimated Traditional and Genomic Breeding Values using Single and Multi-Trait Analyses

نویسندگان [English]

  • s. foroutanifar 1
  • h. mehrbani yeganeh 2
  • Hossein Moradi Shahrbabak 3
چکیده [English]

The aim followed in this study was to use the multi and single trait analyses for a prediction of genomic and traditional breeding values and to make a comparison of the accuracies of these methods. A base population of 100 animals (50 males and 50 females) was randomly mated for 50 generations to create linkage disequilibrium among loci. The simulated genome size was 10 Morgan, equally divided among 10 chromosomes. On each chromosome, SNP markers were evenly located and QTLs randomly distributed over the genome. Single and multi-trait analyses were employed to BLUP estimate the SNP effects. Genomic breeding values of the animals, for each trait, amounted to the sum of SNP effects for all the loci. Results indicated that the accuracies of genomic breeding values were higher than those of traditional ones. Accuracy of breeding values increased as heritability, map density and the number of individuals, in training population, increased. High genetic correlation between the two traits led to the increased genomic and traditional breeding value accuracies.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Genomic Selection
  • Multi-trait analysis
  • Single trait analysis
  • Traditional selection