8954856055505db

مطالعه تنوع ژنتیکی بز سرخ جبالبارز با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

نویسندگان

1 عضو هیأت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان

2 دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج

3 عضو هیأت علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج

4 دانشجوی دکتری ژنتیک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت

5 عضو هیأت علمی بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت

6 عضو هیأت علمی مرکز آموزش عالی، جهاد کشاورزی کرمان

7 اعضای هیأت علمی دانشگاه شهید باهنر کرمان

چکیده

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت بز سرخ جبالبارز با استفاده از 8 نشانگر ریزماهواره، شامل BM1312، MAF64، ILSTS034، ILSTS059، OraFCB20، IL2RA، LSCV24 و LSCV11 مطالعه شد. نمونه خون از 100 راس بز سرخ جبالبارز از ده گله به صورت تصادفی گرفته شد و تخلیص DNA با استفاده از کیت DIATOM DNA PREP انجام گرفت. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای این جایگاه‌ها انجام گرفت و تمامی هشت جایگاه مورد مطالعه از چند شکلی مناسبی برخوردار بوده و میانگین تعداد آلل مشاهده شده برای آن ها 62/7 به دست آمد. در پنج جایگاه ILSTS034، ILSTS059، OraFCB20، IL2RA و LSCV11 انحراف معنی‌داری را از تعادل هاردی- واینبرگ مشاهده شد (05/0P<). دامنه هتروزایگوتی در این جمعیت از 7616/0 برای جایگاه IL2RA تا 8743/0 برای جایگاه OraFCB20 متفاوت بود. شاخص شانون و محتوی چند شکلی (PIC) نیز نشان داد که جایگاه IL2RA دارای کمترین تنوع و جایگاه ORAFCB20 دارای بیشترین تنوع می‌باشند. همچنین تعداد آلل‌های مشاهده شده، تعداد آلل مؤثر و هتروزایگوتی مورد انتظار برای هر جایگاه محاسبه گردید. میانگین هتروزایگوتی برای این جمعیت 8116/0 برآورد گردید. در مجموع می‌توان نتیجه گرفت که جمعیت بز سرخ جبالبارز از تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی برخوردار است، بنابراین، می‌توان در برنامه‌های حفاظت و اصلاح نژادی در این جمعیت از این پتانسیل به خوبی بهره‌برداری نمود.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Study of Genetic Variation within Red Jabal Barez Goat Population Using Microsatellite Markers

نویسندگان [English]

  • Mohammadreza Mohammadabadi 1
  • Amin Shahabi 2
  • Alireza Noshari 3
  • Nahid Askari 4
  • Omid Dayani 1
  • Amin Khezri 1
  • Morteza Sataei Mokhtari 5
  • Mohammad Soflaei 6
  • Ahmad Ayatolahi 7
چکیده [English]

Genetic diversity of Red Jabal Barez red goat population was studied based on eight microsatellite markers consist BM1312, MAF64, ILSTS034, ILSTS059, OraFCB20, IL2RA, LSCV24 and LSCV11. Blood sample extracted of 100 Red Jabal Barez goats were randomly collected from 10 farms and DNA was isolated using the Diatom DNA PREP kit. The PCR reactions were successfully done and all loci showed suitable polymorphism with 7.62 alleles, on average. Five loci of LSCV11, ILSTS034, ILSTS059, OraFCB20, IL2RA were at Hardy-Weinberg disequilibrium (P<0.05). In this population, hetrozygosity varied from 0.7616 at IL2RA to 0.8743 at OraFCB20 locus and the same loci had the lowest and the highest diversity based on Shannon index and polymorphic information content (PIC), respectively. Number of observed and effective alleles and expected hetrozygosity were also calculated for each locus. Average hetrozygosity was estimated as 0.81 for this population. It can be concluded that Red Jabalbarez goat benefits from approximately high genetic variation. Therefore we can well use this potential in conservative and breeding programs for this population.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Genetic variation
  • Heterozygosity.
  • Microsatellite
  • Red Jabal Barez goat