دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Effect of extracted peptides from sunflower seed meal on performance, carcass characteristics, and antioxidant activity in broiler chickens اثر پپتیدهای استخراج شده از کنجاله تخم آفتابگردان بر عملکرد، ویژگی‌های لاشه و فعالیت آنتی‌اکسیدانی در جوجه‌های گوشتی 603 620 94451 10.22059/ijas.2023.356096.653937 FA حمید اشکور قربانی 'گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران منصور رضایی گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران محمد کاظمی فرد گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران Journal Article 2023 04 11 This experiment was conducted to investigate the effect of extracted peptides from sunflower seed meal on performance, carcass characteristics, and antioxidant activity in broiler chickens. In this experiment, 200 Ross 308 male broiler chicks were used in a completely randomized design with five treatments, four replicates, and 10 chicks per each replicate, for 26 days. Experimental treatments included: 1) Control diet without any additives, 2) Control diet + 300 mg vitamin E per kg diet, 3) Control diet + 250 mg sunflower seed meal peptides per kg diet, 4) Control diet + 500 mg sunflower seed meal peptides per kg diet, 5) Control diet + 1000 mg sunflower seed meal peptides per kg diet. There were significant differences between treatments for feed conversion ratio and body weight gain in grower (days 11-26)and whole periods(days 1-26) of the experiment (p<0.05). The most, and least body weight gain belonged to treatment 5, and control treatment. Treatment 5 showed least feed conversion ratio in grower and whole period (1.37 and 1.36) respectively (p<0.05). The effect of experimental treatments on carcass percentage was significan and highest carcass percentage belonged to treatment 5 (73.31%), and the lowest was observed in treatment 2 (68.37%) (p<0.05). The malondialdehyde concentration in breast and thigh meat treatments received different levels of peptides and also treatment 2 was lower than the control treatment. In conclusion, results of the present experiment, showed that use of sunflower seed meal peptides have antioxidant activity and can improve performance, increase carcass quality, and meat stability during storaging through decreasing fat oxidation. این آزمایش به منظور بررسی اثر پپتیدهای استخراج‌ شده از کنجاله تخم ‌آفتابگردان بر عملکرد، ویژگی‌های لاشه و فعالیت آنتی‌اکسیدانی در جوجه گوشتی انجام شد. در این آزمایش از 200 قطعه جوجه گوشتی نر سویه راس 308 در قالب طرح کاملا تصادفی با 5 تیمار و 4 تکرار و 10 قطعه جوجه در هر تکرار، به مدت 26 روز استفاده شد. تیمارهای آزمایشی شامل: 1) جیره شاهد بدون افزودنی 2) جیره‌ شاهد + 300 میلی‌گرم ویتامین ای در کیلوگرم جیره 3) جیره‌ شاهد + 250 میلی‌گرم پپتید استخراج ‌شده‌ از کنجاله تخم آفتابگردان در کیلوگرم جیره 4) جیره‌ شاهد + 500 میلی‌گرم پپتید استخراج ‌شده‌ از کنجاله تخم آفتابگردان در کیلوگرم جیره 5) جیره‌ شاهد + 1000 میلی‌گرم پپتید استخراج ‌شده‌ از کنجاله تخم آفتابگردان در کیلوگرم جیره بودند. از نظر مصرف خوراک و افزایش وزن در دوره‌ رشد ( 26-11 روزگی) و در کل دوره آزمایش (26-1 روزگی)، اختلاف معنی‌داری بین تیمارها مشاهده شد ( 05/0< (P. بیشترین و کمترین مقدار مصرف خوراک و افزایش وزن، به ترتیب مربوط به تیمار 5 و تیمار شاهد بود. کمترین مقدار ضریب تبدیل خوراک در دوره‌ رشد و در کل دوره، مربوط به تیمار 5 ( به ترتیب37/1و 36/1) بود که با سایر تیمارها اختلاف معنی‌داری داشت ) 05/0<(P. تاثیر تیمارهای آزمایشی بر درصد لاشه معنی‌دار بود ) 05/0< (P. بیشترین درصد لاشه مربوط به تیمار 5 (3/73 درصد) و کمترین درصد لاشه مربوط به تیمار 2 (4/68 درصد) بود ) 05/0< (P. غلظت مالون‌دی‌آلدئید در گوشت سینه و ران در گروه‌های دریافت کننده‌ سطوح مختلف پپتید و تیمار 2 کمتر از تیمار شاهد بود. به طورکلی، نتایج این آزمایش نشان داد که استفاده از پپتیدهای زیست‌فعال استخراج شده از کنجاله تخم‌آفتابگردان، علاوه بر بهبود عملکرد، سبب افزایش کیفیت گوشت در مدت ذخیره‌سازی پس از کشتار از طریق کاهش اکسیداسیون چربی‌ها می‌شود.

https://ijas.ut.ac.ir/article_94451_2f0ffaed90bec015fc2f3823ed782b8e.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 The Effect of Gestation Period Length on Productive Performance of Holstein Dairy Cows and Health of Calves اثر طول دوره آبستنی بر عملکرد تولیدی گاوهای شیری و سلامت گوساله‌های هلشتاین 621 634 96536 10.22059/ijas.2024.359948.653949 FA کامران پژوهنده گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران طاهره امیرآبادی فراهانی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران. نجمه اسلامیان فارسونی گروه علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان چهارمحال و بختیاری، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شهرکرد، 0000-0002-7921-3302 Journal Article 2023 08 27 The purpose of the current study was to investigate the effect of gestation length (GL) on productive performance of Holstein dairy cows and the health of calves. In total, 3,780 Holstein singleton cows (1,994 heifers and 1,786 cows) from two commercial dairy farms were used. The mean of GL for 3,780 cows was 276 ± 5 d, and cows were classified as short (SGL; more than 1SD less than the population mean, mean = 267, range 258 to 270 d), average (AGL; population mean ± 1SD, mean = 276, range 271 to 281 d), and long (LGL; more than 1SD greater than the population mean, mean = 284, range 282 to 294 d) gestation length. In primiparous cows, milk yield was not different across groups. However, in multiparous cows, the SGL cows had lower milk yield than the AGL cows. In both primiparous and multiparous cows, calf birth weight was lower in SGL group than AGL group, but the LGL group had higher calf birth weight than AGL group. The incidence of pneumonia and diarrhea of calf were not affected by the GL. In general, cows with short GL had lower productive performance and calf birth weight, but the incidence of pneumonia and diarrhea of the calf were similar among groups. هدف از پژوهش حاضر بررسی اثر طول دوره آبستنی بر عملکرد تولیدی گاوهای شیری و سلامت گوسالههای هلشتاین بود. در کل، 3780 رأس گاو هلشتاین تک قلوزا (1994 رأس تلیسه و 1786 رأس گاو) با دامنه طول دوره آبستنی 258 تا 294 روز از دو مزرعه شیری تجاری استفاده شد. میانگین طول دوره آبستنی در 3780 رأس گاو 5 ± 276 روز بود که به صورت دوره آبستنی کوتاه (SGL؛ بیش از یک انحراف معیار (1SD) کمتر از میانگین جمعیت، میانگین = 267، دامنه 258 تا 270 روز)، متوسط (AGL؛ میانگین جمعیت ± یک انحراف معیار، میانگین = 276، دامنه 271 تا 281 روز) و بلند (LGL؛ بیش از یک انحراف معیار (1SD) بیشتر از میانگین جمعیت، میانگین = 284، دامنه 282 تا 294 روز) طبقه‌بندی شدند. در گاوهای یکبار زایش، تولید شیر بین تیمارها متفاوت نبود. اما، در گاوهای چند بار زایش گروه SGL تولید شیر کمتری نسبت به گروه AGL داشتند. در گاوهای یکبار زایش و چند بار زایش، وزن تولد گوساله در گروه SGL کمتر از گروه AGL بود. اما، گروه LGL وزن تولد گوساله بیشتری نسبت به گروه AGL داشتند. بروز پنومونی و اسهال گوساله نیز تحت تأثیر طول دوره آبستنی قرار نگرفت. در مجموع، گاوها با طول دوره آبستنی کوتاه عملکرد تولیدی و وزن تولد گوساله کمتری داشتند، اما بروز پنومونی و اسهال گوساله در بین گروهها مشابه بود.

https://ijas.ut.ac.ir/article_96536_9c01ce7e9c7ac6711040525c8b12d3c1.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 The effect of fermented sesame meal with a mixture of Lactobacillus plantarum, Bacillus subtilis and Aspergillus niger fungus on growth performance, carcass characteristics, blood parameters, immunity and bone mineralization in broiler chickens اثر کنجاله کنجد تخمیر شده با مخلوطی از لاکتوباسیلوس پلانتاروم، باسیلوس سابتیلیس و قارچ آسپرژیلوس نایجر بر عملکرد رشد، خصوصیات لاشه، فراسنجه‌های خونی، ایمنی و معدنی‌شدن استخوان در جوجه‌های گوشتی 635 650 96547 10.22059/ijas.2024.373109.654004 FA یاسر سالاری تلمادره گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائم شهر، قائم شهر، ایران وحید رضایی پور گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائم شهر، قائم شهر، ایران روح الله عبداله پور گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائم شهر، قائم شهر، ایران شهاب الدین قره ویسی گروه علوم دامی- دانشکده کشاورزی- دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائم شهر- قائم شهر- ایران Journal Article 2024 02 29 This study was conducted to investigate the effect of fermented sesame meal on performance, carcass characteristics, blood parameters, immunity and bone mineralization in broiler chickens. A total of 525 broiler chicks were randomly allocated into 7 treatments with five replicate per each. Lactobacillus plantarum PTCC1058 and Bacillus subtilis PTCC1156 in combination with Aspergillus niger PTCC5010 were used to ferment sesame flour. Experimental treatments included a basal diet and basal diet containing 6 or 12% fermented sesame meal and 6 or 12% untreated sesame meal with or without phytase enzyme. The treatment containing 6% USM+phytase enzyme and 12% FSM showed the highest weight gain during the starter and total phases in broilers, respectively (P<0.05). During total phase, feed conversion ratio improved in broilers fed diets containing 6 and 12% FSM and USM+phytase (P<0.05). The highest and lowest blood glucose concentrations were observed in the treatments containing 6% USM + phytase enzyme and 12% USM + phytase enzyme, respectively (P <0.05). The results of antibody titer against Gamboro and bronchitis showed that there was a significant difference in the titer against Gamboro between experimental treatments (p<0.05). The highest percentage of ash, phosphorus and calcium was observed in the treatment containing 6% FSM (P<0.05). The general result of the present study showed that the processing of sesame meal by fermentation method improved growth prformance and increased the level of antibody titer against Gamboro disease in broiler chickens. In addition, Phytase supplement in sesame meal diets improved bone mineralization in broilers. این تحقیق جهت بررسی اثر کنجاله کنجد تخمیرشده بر رشد، خصوصیات لاشه، فراسنجه‌های خونی، ایمنی و معدنی‌شدن استخوان در جوجه‌های گوشتی انجام شد. از 525 قطعه جوجه گوشتی در 7 تیمار و هر تیمار دارای 5 تکرار استفاده شد. برای تخمیر کنجاله کنجد از دو نوع باکتری لاکتوباسیلوس پلانتاروم PTCC1058 و باسیلوس سابتیلیس PTCC1156 همرا با قارچ آسپرژیلوس نایجر PTCC5010 استفاده شد. تیمارهای آزمایشی شامل: 1یک جیره پایه و جیره های بر پایه 6 و 12 درصد کنجاله کنجد تخمیری و جیره پایه حاوی 6 و 12 درصد کنجاله کنجد خام با و بدون آنزیم فیتاز بود. نتایج نشان دهنده بهبود ضریب تبدیل غذایی در جوجه های گوشتی تغذیه شده با سطوح 6 و 12 درصد کنجاله کنجد تخمیری و نیز 6 درصد کنجاله کنجد خام همراه با آنزیم فیتاز بود (05/0>P). بالاترین و پایین‌ترین غلظت گلوکز خون به ترتیب در تیمار حاوی 6 درصد کنجاله کنجد خام + آنزیم فیتاز و تیمار حاوی 12 درصد کنجاله کنجد خام + آنزیم فیتاز مشاهده شد (05/0>P). بالاترین تیتر گامبورو در تیمار حاوی 12 درصد کنجاله کنجد خام + آنزیم فیتاز مشاهده شد (05/0>P). بالاترین درصد خاکستر، فسفر و کلسیم در تیمار حاوی 6 درصد کنجاله کنجد تخمیر شده مشاهده شد (05/0>P). نتیجه کلی تحقیق حاضر نشان داد که فرآوری کنجاله کنجد به روش تخمیر سبب بهبود عملکرد رشد و افزایش سطح تیتر آنتی‌بادی علیه بیماری گامبورو شد. همچنین افزودن آنزیم فیتاز به جبره های حاوی کنجاله کنجد خام سبب بهبود ویژگی های استخوان درشت نی در جوجه های گوشتی شد.

https://ijas.ut.ac.ir/article_96547_2eb8541d73ad366c583a264068020d65.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Genomic association study to identify candidate genes for early growth traits in chickens مطالعه ارتباط ژنومی برای شناسایی ژن‌های کاندیدا در مراحل اولیه رشد در مرغ 651 664 97797 10.22059/ijas.2024.372924.654003 FA زینب عسگری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران علیرضا احسانی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. علی اکبر مسعودی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. رسول واعظ ترشیزی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Journal Article 2024 03 04 So far, several methods have been used to identify genetic factors affecting polygenic traits. Common methods are least squares regression analysis, maximum likelihood regression analysis, and Bayesian. The superiority of Bayesian methods over other methods is that it is possible to use all SNPs in the model simultaneously. The simultaneous presence of markers can prevent overestimation of marker effects and increase the probability of identifying true positive SNPs. Therefore, in the present study, the BayesCpi method was used to identify SNPs related to body weight at early stages of growth (i.e. body weight at week 2) in an F2 population of mixed chickens. For this purpose, the Illumina 60K SNP bead chip was used to genotype the present population, including 312 chickens from the F2 population. According to the results of the analysis, 16 SNPs with a Bayes Factor (BF) between 20 and 150 were known and suggested as markers for body weight at early age. Results of post-GWAS showed that these SNPs were distributed across 4 chromosomes and were located close to, or inside the 16 genes. Among the identified genes, 12 genes were protein-encoding and 4 were noncoding RNAs. To identify genes associated with each SNP in candidate regions, 0.5 Mb around each significant SNP was considered. تاکنون روشهای متعددی برای شناسایی فاکتورهای ژنتیکی مؤثر بر صفات پلیژنیک مورداستفاده قرارگرفته است. روش‌های رایج استفاده‌شده شامل آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداقل مربعات، آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداکثر درست نمایی و روش‌های بیزی می‌باشد. از برتری روش‌های بیزین نسبت به سایر روش‌ها می‌توان به امکان استفاده هم‌زمان از کل مارکرها در مدل اشاره نمود که منجر به جلوگیری از بیش برآورد اثرات نشانگرها شده و احتمال شناسایی SNPهای مثبت واقعی را افزایش می‌دهد. ازاین‌رو، در مطالعه حاضر برای شناسایی SNPهای مرتبط با وزن بدن در سنین اولیه (2 هفتگی)، در یک جمعیت F2 از مرغان آمیخته، از روش بیز Cpi استفاده شد. سپس، برای تعیین ژنوتیپ جمعیت حاضر شامل 312 مرغ F2، چیپ‌های تجاریIllumina 60K استفاده گردید. درنهایت، 16 مارکر SNP که دارای فاکتور بیز بین 20 تا 150 بودند، به‌عنوان مارکرهای پیشنهادی برای وزن بدن در این سن در نظر گرفته شد. این SNPها بر روی 4 کروموزوم توزیع‌شده‌اند و به‌صورت سببی و یا به‌واسطه وجود عدم تعادل پیوستگی با 16 ژن ارتباط نزدیک دارند. از ژنهای شناسایی‌شده 12 ژن، کد کننده پروتئین و 4 ژن RNA غیرکدکننده می‌باشند. برای شناسایی ژن‌های مرتبط با هر SNP در مناطق کاندیدا، Mb 5/0 اطراف هر SNP معنیدار در نظر گرفته شد.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97797_45552aa4e20bcb250dfb66fb0c19cdb4.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Economic Assessment of Beekeeping Farms in Fereydunshahr County in Isfahan Province بررسی وضعیت اقتصادی واحدهای پرورش زنبورعسل در شهرستان فریدونشهراستان اصفهان 665 681 96546 10.22059/ijas.2024.371492.653994 FA سید عرفان حسینی گروه مدیریت و توسعه کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، تهران، ایران علی اکبر براتی گروه مدیریت و توسعه کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، تهران، ایران حسین شعبانعلی فمی گروه مدیریت و توسعه کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، تهران، ایران Journal Article 2024 01 22 Today, despite the valuable functions of beekeeping, the economic status of this industry is still below optimal levels. Therefore, analyzing the economic status of beekeeping farms and the economic factors affecting their performance is a crucial step towards improvement. Thus, this study aimed to analyze the economic status of beekeeping farms and the economic factors affecting their performance in Fereydunshahr county, located in Isfahan province, and to provide suggestions for its improvement. The data was collected through face-to-face and telephone interviews using a researcher-made questionnaire during the spring of 2022. The sample size of the study consisted of 140 beekeepers, selected using stratified sampling from the total population of beekeepers in Fereydunshahr county (N=210). Multiple variable linear regression was used for data analysis. The results showed that there was a high level of heterogeneity in the average added value per hive in different farms. Furthermore, the significant economic factors affecting the performance of farms, including the variables of the average added value per hive (0.342), the beekeeper's annual income (0.301), suitable and modern packaging (0.270), average cost per hive (0.234), direct sales of products (-0.206), and processing raw products (0.169). These factors were able to explain 63% of the total performance variance. Finally, solutions such as the formation of an integrated system for adequate and timely distribution of inputs, promotion of technical and managerial knowledge based on successful farms, and the establishment of a contract beekeeping system are suggested to improve the economic status of beekeeping farms. امروزه علی‌رغم کارکردهای ارزشمند پرورش زنبورعسل، وضعیت اقتصادی این صنعت همچنان با حد مطلوب خود فاصله دارد. تعیین وضع اقتصادی موجود در واحدهای پرورش زنبورعسل ابتدایی‌ترین گام در راستای دستیابی به وضعیت مطلوب است. بنابراین، پژوهش حاضر تلاش کرده ‌است تا وضعیت اقتصادی واحدهای پرورش زنبورعسل و عوامل اقتصادی مؤثر بر عملکرد آن‌ها در شهرستان فریدونشهر واقع در استان اصفهان را بررسی کرده و پیشنهادهایی را در راستای بهبود آن ارائه کند. داده‌های استفاده‌ شده در این مطالعه در سال 1401 و از طریق پرسشنامه محقق‌ساخته گردآوری شد. حجم نمونه مورد مطالعه 140 زنبوردار بود که با نمونه‌گیری طبقه‌ای با انتساب متناسب از بین زنبورداران شهرستان فریدونشهر (210 زنبوردار) انتخاب شدند. برای تحلیل داده‌ها از رگرسیون خطی چند متغیره بهره گرفته شد. نتایج حاصل از آمار توصیفی حاکی از وجود ناهمگونی بالا در ارزش افزوده متوسط هر کندو در واحدهای مختلف بود. نتایج حاصل از تجزیه رگرسیونی نشان داد که متغیرهای اقتصادی معنی‌دار اثرگذار بر عملکرد واحدهای پرورشی، متغیرهای ارزش افزوده متوسط هر کندو (342/0)، سطح درآمد سالیانه زنبوردار (301/0)، بهره‌گیری از بسته‌بندی مناسب و مدرن (270/0)، هزینه متوسط هر کندو (234/0)، فروش مستقیم و بدون ‌واسطه محصولات (206/0-) و فرآوری محصولات خام تولیدی (169/0) بودند که در مجموع توانستند 63 درصد از کل واریانس عملکرد را تبیین کنند. در نهایت، راهکارهایی نظیر شکل‌گیری سامانه‌ای جامع و یکپارچه در راستای توزیع کافی و به‌موقع نهاده‌ها، ترویج دانش فنی و مدیریتی واحدهای پرسود در سطح شهرستان و استقرار نظام زنبورداری قراردادی به‌منظور بهبود وضعیت اقتصادی واحدهای پرورش زنبورعسل پیشنهاد می‌شود.

https://ijas.ut.ac.ir/article_96546_0c4c22ee13b707a9af0de33767267be5.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Considering the culling reasons and trend of its changes Using 16 years data of mega dairy Holstein farms in Iran بررسی دلایل حذف گاوهای شیری هلشتاین و روند تغییرات آن با استفاده از داده‌های 16 ساله گاوداری͏های بزرگ ایران 683 691 97790 10.22059/ijas.2024.371219.653993 FA سعید مختار زاده دیلمقانی گروه علوم دامی، پژوهشکده کشاورزی ، سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران تهران، ایران محمد رضا سنجابی گروه علوم دامی، پژوهشکده کشاورزی، سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران-تهران،ایران عبدالرضا صالحی گروه علوم دام و طیور، دانشکده فناوری کشاورزی (ابوریحان)- دانشگاه تهران، تهران، ایران Journal Article 2024 01 28 Cow culling is one of the main economic aspects in mega-dairy cattle farms management. Therefore, in this research the cow culling reasons in 20 Iranian industrial Holstein mega-dairy farms during the last 16 years (2005 -2021 years) was considered. A total of 129454 cows data were used to analyze by T-Student methods of SAS software version 9.4. Based on the culling reason, data were classified into 11 classes. The annual culling rate of the milking cows was approximately 23.5%. Predominant reasons for culling were fertility problems and abortion (23.7%), metabolic and digestive disorders (15.8%), and infectious disorders (15.6%). The investigation of the trend of culled cows showed that fertility problems and abortion increased from 22.0% in 2005 to 24.6% in 2021. Also, culled cow’s percentage for metabolic and digestive disorders decreased (from 24.0% to 13.0%) and the culling percentage in year 2021 significantly differed from the average of the past 15 years, also feet/claw disorders (P<0.01) and Infection diseases (P<0.01) were significantly higher than the average of the past 15 years. It means that in the final year of the report, the culling of cows due to metabolic and digestive problems as well as udder disorders decreased compared to the 16-year averages, voluntary culling did not increase or change, but the culling percentage due to infectious diseases and lameness was increased. Increasing trend of voluntary culling can be improved by improving fertility and preventing abortion, along with decreasing slaughter culling of lameness and infectious diseases, and ultimately increase herd profitability. حذف گاو یکی از جنبه‌های اصلی اقتصادی در مدیریت گاوداری‌های صنعتی بزرگ است. بنابراین، در این تحقیق دلایل حذف گاوها طی 16 سال (از سال 1385 تا 1400)، در 20 مزرعه گاو شیری صنعتی هلشتاین ایران مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع دادههای 129454 راس گاو برای بررسی علل درصدهای حذف در سال آخر مورد گزارش با میانگین 15 سال قبل، با استفاده از روش آماری T-Student نرم‌افزار SAS نسخه 9.4 تجزیه و تحلیل گردید. میزان حذف کشتارگاهی سالانه گاوهای شیری 5/23 درصد بود. علت‌های اصلی عمده حذف گاوها در این بررسی، مشکلات باروری و سقط جنین (7/23 درصد)، اختلالات متابولیکی و گوارشی (8/15درصد) و بیماری‌های عفونی (6/15درصد) بود. بررسی روند حذف نشان داد که مشکلات باروری و سقط جنین از 0/22 درصد در سال 1385 به 6/24 درصد در سال 1400 افزایش یافته است. همچنین درصد مشکلات متابولیکی و گوارشی گاوهای حذف شده در این مدت کاهش (از 7/23 درصد به 0/13 درصد)، و درصد حذف در سال 1400 با میانگین 15 سال تفاوت معنی‌داری داشت (P<0.01). مشکلات اندام حرکتی (P<0.01) و بیماری‌های عفونی (P<0.01) در سال 1400 نسبت به میانگین 15 سال بیشتر بود. لذا اگرچه در سال پایانی گزارش، حذف گاوها به دلیل مشکلات متابولیکی و گوارشی (P<0.01) و همچنین اختلالات پستانی (P<0.01) نسبت به میانگین 15 سال کاهش داشت، حذف اختیاری تغییری نداشت اما درصد حذف به دلیل بیماری‌های عفونی و لنگش افزایش داشت. حذف اختیاری با بهبود باروری و جلوگیری از سقط جنین، کاهش حذف کشتارگاهی و بیماری‌های عفونی، موجب سودآوری گله می شود.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97790_59e116aafe930fd82ff8c941850cdaab.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Efficiency of genotyping by sequencing technology and its comparison with single nucleotide polymorphism array in an F2 chickens population کارآیی فن‌آوری تعیین ژنوتیپ از طریق توالی‌یابی و مقایسه آن با آرایه‌ی چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی در یک جمعیت مرغ نسل دو 693 711 97795 10.22059/ijas.2024.372827.653999 FA نرجس گرگانی فیروزجاه دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. رسول واعظ ترشیزی گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس تهران ایران. علیرضا احسانی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران علی اکبر مسعودی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. پیمانه داودی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. حسین بانی سعادت گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. 0000-0001-9034-0372 Journal Article 2024 02 19 For researches, there is a wide variety of available technologies to collect molecular information in the field of chicken genomics. These technologies, which consist of single-nucleotide polymorphism (SNP) arrays and genotyping by sequencing (GBS), depending on the goals of the study, can have different applications. The aim of this study was to compare the results of markers genotyped by two technologies, namely, 60 K SNP BeadChip and genotyping by sequencing, using data collected on F2 chicken population resulting from a reciprocal crosses between a native bird of Urmia and a fast-growing commercial Arian line. In genotyping by GBS, 882,918 SNPs were identified, of which 815,613 SNPs (92.40%) were located on chromosomes 1 to 28. In 60 K SNP array, the number of SNPs for each sample were 51347, which were distributed on chromosomes 1 to 28. The GBS data identified more markers and haplotype blocks than the 60 K SNP array. The rate of linkage disequilibrium (LD) in the physical distances of 10, 100 and 1000 kbp in GBS was less than that of SNP array. The large variety of SNPs in the GBS resulted in a uniform population structures and kinship. Also, in addition to the high performance for identifying single nucleotide polymorphisms, the technology of GBS also reduced the costs of the genotyping for each sample, therefore, it seems that the use of genotyping by sequencing technology could be a suitable alternative method to the 60 K SNP BeadChip array technology for genome-wide association studies in chicken population. پژوهش‌گران حوزه ژنوم در بخش طیور انواع گسترده‌ای از فناوری‌ها را برای جمع‌آوری اطلاعات ژنتیکی در اختیار دارند. این فناوری‌ها که عبارت از آرایه‌های‌ چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی مرغ و تعیین ژنوتیپ مبتنی بر توالی‌یابی هستند، بسته به اهداف مطالعه می‌تواند استفاده‌های مختلفی داشته باشند. هدف از مطالعه حاضر، مقایسه‌ی نتایج حاصل از توالی‌یابی یک جمعیت F2 حاصل از تلاقی دو طرفه پرنده‌های بومی ارومیه و یک لاین تجاری گوشتی آرین با استفاده از فن‌آوری‌های توالی‌یابی و آرایه K60 بود. در فن‌آوری توالی‌یابی، 882918 نشان‌گر شناسایی شد که 815613 آن‌‌ها (40/92 درصد) مربوط به کروموزوم‌های 1 تا 28 بودند. در این فن‌آوری، کروموزوم 1 بیشترین و کروموزوم W کم‌ترین تعداد نشان‌گر را داشتند. در فن‌آوری آرایه، تعداد 51347 نشان‌گر بر روی کروموزوم‌های 1 تا 28 پراکنده بودند و کروموزوم 1 بیشترین و کروموزوم 16 کم‌ترین تعداد نشان‌گر را نشان داد. داده‌های حاصل از فن‌آوری توالی‌یابی، تعداد نشان‌گر و بلوک‌های هاپلوتایپی بیشتری نسبت به آرایه‌ی 60 کیلوبازی شناسایی کرد. میزان عدم تعادل پیوستگی در فواصل فیزیکی 10 کیلوباز، 100 کیلوباز و 1000 کیلوباز در فن‌آوری توالی‌یابی نسبت به آرایه‌ی 60 کیلوباز کم‌تر بود. تنوع زیاد نشان‌گرها در داده‌های ژنوتیپ‌کردن از طریق توالی‌یابی موجب شد ساختارهای جمعیتی و خویشاوندی یکنواختی ایجاد شود. همچنین، علاوه بر عملکرد بالا در شناسایی نشان‌گرها، فن‌آوری ژنوتیپ کردن از طریق توالی‌یابی، هزینه‌های تعیین ژنوتیپ به‌ازای هر نمونه را نیز کاهش داد، بنابراین، به نظر می‌رسد استفاده از فن‌آوری ژنوتیپ کردن از طریق توالی‌یابی بتواند جایگزین مناسبی برای فن‌آوری آرایه‌ی K60 در مطالعات پویش ژنوم در جمعیت‌های مرغ شود.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97795_04099638c4c23447c521c1b4a34f9c60.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Identification of genomic variants and considering their effects in Mazandarani buffaloes شناسایی تنوعهای ژنومی و بررسی نقش آنها در سطح ژنوم گاومیشهای نژاد مازندرانی 713 725 94456 10.22059/ijas.2023.359835.653948 FA میلاد حسینی گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران حسین مرادی شهربابک گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران محمد مرادی شهربابک گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران 0000-0002-5255-609X Journal Article 2023 06 11 Nowadays, with the progress obtained in molecular genetic techniques and bioinformatics, alternative methods have been invented to increase the speed and efficiency of DNA sequencing and their roles in genome level. In the whole-genome sequencing method, the whole genome sequence of organism (nuclear-genome with mitochondrial DNA) is sequenced. One of the important topics in genomics is genome differences, including single-nucleotide polymorphisms and INDELs for the relationship between genotype and phenotype. Polymorphisms are powerful tools for molecular analysis of economic traits and are important in breeding programs. For this purpose, whole-genome variations of Mazandarani buffaloes were identified and classified. In this study, the whole-genome of 4 Mazandarani buffaloes was sequenced with the Illumina platform. Data quality was measured by FastQC software. BWA-MEM was used for alignment with reference genome. Finally, the variants were obtained using freebayes and the SnpEff was used to calculate the effects of the variants. The result of aligning led us to identification of 56537534 SNPs, and 6128529 indels with an average coverage of x4 to x13. The most number of variants were observed on 1 and X chromosomes, and the least number were in 23 and mitochondrial chromosomes. The transition, transversion and rate of transition/transversion mutations were 236549743, 108015966 and 2/19 respectively. Also, the mutations was calculated. The frequency of variants in intergenic regions was estimated to be 52746727, intron 23560994, downstream 3713594, upstream 3571409 and exon 574093. Considering that this research is the only one that carried out to identify the genomic variations of Mazandarani buffalo, the identified genomic variations can be used for the development of SNP-arrays for Iranian breeds. امروزه با پیشرفت‌ فناوری‌های ژنتیک مولکولی و توسعه پایگاه‌های بیوانفورماتیکی، روش‌های جایگزینی جهت افزایش سرعت و بازدهی تعیین‌ توالی دی‌ان‌ای و بررسی نقش آنها در سطح ژنوم توسعه یافته است. در روش توالی‌یابی‌کل‌ژنوم، ‌ژنوم موجود زنده (ژنوم هسته‌ای به‌همراه دی‌ان‌ای میتوکندریایی) بطور کامل توالی‌یابی می‌گردد. یکی از مباحث مهم در حوزه ارزیابی‌های ژنومی، مطالعه تفاوت‌ها و تنوع ژنوم، شامل چندشکلی‌های‌تک‌نوکلئوتیدی(SNP) و حذف‌و‌درج‌ها بمنظور شناخت ارتباط میان ژنوتیپ و فنوتیپ می‌باشد. در ‌ژنوم موجودات، چندشکلی‌ها، ابزارهای نیرومندی برای واکاوی مولکولی صفات اقتصادی هستند و کاربردهای بالقوه‌ای در برنامه‌های اصلاحی دارند. برای دست‌یابی به این اهداف، تنوع‌های ‌ژنومی گاومیش‌های مازندرانی شناسایی و طبقه-بندی شدند. در‌این مطالعه ‌ژنوم 4راس گاومیش مازندرانی با فناوری ایلیومینا توالی‌یابی شد. سنجش کیفیت داده‌ها توسط نرم‌افزار FastQC انجام شد. برای هم‌ردیفی با ژنوم‌مرجع از نرم‌افزار BWA-MEM استفاده شد. در‌نهایت واریانت‌ها با‌‌استفاده از freebayes شناسایی و به‌منظور محاسبه‌ی اثرات واریانت‌ها با ذکر نوع، محل و تعداد آن‌ها از برنامه SnpEff استفاده شد. یافته‌ها: نتیجه‌ی همردیفی خوانش‌ها، با ژنوم مرجع منجر‌ به شناسایی 56537534 نشانگر SNP و 6128529 حذف‌و‌درج (ایندل) با میانگین پوشش x4 تاx 13 شد. بیشترین واریانت‌ها در کروموزوم‌های 1 و جنسی (X) و کم‌ترین آن در کروموزوم‌‌های 23 و میتوکندریایی مشاهده شد. جهش‌های جابه‌جایی 236549743 و معکوس 108015966 بود. همچنین نرخ جهش‌های جابه‌جایی/ معکوس 19/2 محاسبه شد. فراوانی واریانت‌ها در مناطق بین ژنی 52746727، اینترون 23560994، پایین‌دست‌ژنی 3713594، بالادست‌ژنی 3571409 و اگزون 574093 برآورد شدند. نتیجه‌گیری: با‌توجه به این‌که مطالعه‌ی حاضر تنها تحقیق انجام شده در زمینه‌ی شناسایی تنوع‌های ژنومی گاومیش نژاد مازندرانی می‌باشد، تنوع‌های ژنومی شناسایی‌شده در‌این مطالعه می‌تواند برای توسعه‌ی آرایه‌های نشانگری با چگالی‌ بالادر نژاد‌های ایرانی مورد استفاده قرار گیرد.

https://ijas.ut.ac.ir/article_94456_d27d005253f5609730bd3d9ce161ca27.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 The Effect of Feeding Top-Dress Cottonseed Bioactive Peptide and Organic Selenium in the Prepartum on the Health of the Reproductive Tract and Subsequent Pregnancy in Holstein Dairy Cattle اثر تغذیه پپتید زیست فعال تخم پنبه و سلنیوم آلی در دوره پیش از زایش بر سلامت دستگاه تولید مثلی و آبستنی بعدی در گاوهای شیری نژاد هلشتاین 727 751 97799 10.22059/ijas.2024.373793.654006 FA زینب میرباقری مرویلی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان. ایران. حمید امانلو گروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان،زنجان، ایران نجمه اسلامیان فارسونی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی چهار محال و بختیاری، تحقیقات علوم دامی، ایران 0000-0002-7921-3302 Journal Article 2024 03 14 The aim of this study was to investigate the effect of feeding top dress Hydroxy Seleno Methionine (HSM) as organic Selenium and cotton seed bioactive peptide (CSBP) on body condition, health of the reproductive system and subsequent pregnancy of dairy cows. For this purpose, one hundred and eighty multiparous Holstein cows at the day 21 prior to the expected calving date were assigned to one of four experimental treatments in a randomized complete block design in a 2x2 factorial arrangement: 1) Basal diet (containing mineral selenium as per NRC (2001) recommendations without peptide; 2) Basal diet plus 300 g bioactive peptide; 3) Basal diet plus 1.2 mg organic selenium per kg of dry matter without bioactive peptides; 4) Basal diet plus 1.2 mg organic selenium per kg of dry matter plus 300 grams of bioactive peptide. The inclusion of HSM during the prepartum period resulted in a higher BCS in postpartum and smaller increase in BCS during prepartumd (P < 0.01). Additionally, there was a significant interaction effect between HSM and CSBP on BCS (P < 0.02) and its changes (P < 0.01) during the post-partum periods. The presence of ovarian cysts, number of inseminations per pregnancy, the endometrium and uterine regression scores and pregnancy during the first insemination was not influenced by any of the experimental treatments (P > 0.1). However, HSM had a positive effect on pregnancy during the second insemination (P < 0.05). It can be concluded that supplementing HSM could reduce the BCS changes before and after parturition and subsequent to that, it leads to an enhancement in the pregnancy during the second insemination. هدف از انجام این آزمایش، بررسی اثر تغذیه سرک هیدروکسی سلنو متیونین[1] (HSM) به عنوان سلنیوم آلی و پپتید زیست فعال حاصل از تخم پنبه[2] (CSBP) بر امتیاز وضعیت بدنی[3]، سلامت دستگاه تولید مثلی و آبستنی بعدی گاوهای شیری بود. به این منظور صد و هشتاد راس گاو هلشتاین چند بار زایش کرده 21 روز پیش از تاریخ زایش در قالب طرح بلوک کامل تصادفی در آرایش فاکتوریل 2×2 (دو سطح سلنیوم آلی و دو سطح پپتید زیست فعال) به یکی از 4 تیمار آزمایشی شامل تیمار 1) جیره پایه (حاوی سلنیوم معدنی توصیه شده در NRC (2001) و بدون CSBP؛ تیمار2) جیره پایه + 300 گرم CSBP؛ تیمار 3) جیره پایه + 2/1 میلی‌گرم HSM در هر کیلوگرم ماده خشک و بدون افزودن CSBP؛ تیمار 4) جیره پایه + 2/1 میلی‌گرم HSM در هر کیلوگرم ماده خشک +300 گرم CSBP اختصاص یافتند. BCS در دوره پس از زایش در تیمارهایی که HSM دریافت نمودند بالاتر بود (01/0 > P) و تغییرات BCS کمتر از سایر گروهها در دوره پیش از زایش بود (01/0 > P). همچنین اثر متقابل HSM در CSBP در دوره پس از زایش بر BCS (02/0 > P) و تغییرات BCS معنیدار بود (01/0 > P). کیست تخمدان، تعداد تلقیح به ازای آبستنی، امتیاز اندومتر و رجعت رحمی و آبستنی در تلقیح اول تحت تاثیر هیچ کدام از تیمارهای آزمایشی قرار نگرفت (1/0< P). اما HSM توانست اثر مثبتی بر آبستنی در تلقیح دوم داشته باشد (05/0 > P). میتوان نتیجه گرفت که افزودن HSM منجر به کاهش تغییرات BCS در دوره پیش و پس از زایش شده و به دنبال آن سبب بهبود آبستنی در تلقیح دوم میشود.. [1]. Hydroxy Seleno Methionine (HSM) [2]. Cotton Seed Bioactive Peptide (CSBP) [3]. Body Condition Score (BCS)

https://ijas.ut.ac.ir/article_97799_4f0b75204b7ef2a5f381b628054e1c48.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 The effect of inoculated corn silage with different types of bacteria on Holstein lactating cows’ performance تأثیر سیلاژ ذرت تلقیح شده با باکتری‌های مختلف بر عملکرد گاوهای شیرده هلشتاین 753 768 97791 10.22059/ijas.2024.371311.653997 FA علی بیات گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران فردین هژبری گروه علوم دامی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران 0000-0002-0165-7974 داریوش علیپور گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران. Journal Article 2024 02 07 Corn fodder with 28% DM were harvested, chopped and after applying treatments (106 cfu g-1 FM) were ensiled in 30 kg bags. The experimental treatments were: 1) Silage without microbial inoculation (control), 2) silage inoculated with Lactobacillus fermentum produced in the laboratory (Lab), 3) silage inoculated with mixture of Lactobacillus fermentum, Lactobacillus salivarius, Pediococcus acidilactici and Enterococcus faecium (Lab), and 4) silage inoculated with commercial bacteria containing Enterococcus faecium, Lactobacillus brevis and Lactobacillus plantarum. Sixteen Holstein cows in the middle of lactation (160 ± 10 days of lactation) were used based on a 4 x 4 integrated Latin square design with periods of 21 days. The milk production of treatments was not significantly different from the control, but 3.5% fat corrected milk of cows receiving inoculated silage was more than the control. The percentages of milk fat, protein and solids- non-fat were higher in the first treatment than other groups (P<0.05). Cows fed with laboratory inoculated silages had a higher (P<0.05) DMI than control and third treatment. The digestibility of DM, CP and ADF was higher (P<0.05) in the inoculated treatments than control and the highest was related to the second treatment. The rumen ammonia nitrogen in the first and second treatments was lower (P<0.05) than control. The rumen percentage of acetate was higher (P<0.05) in control and the second treatment, and propionate was higher (P<0.05) in the inoculated treatments than control. The overall conclusion showed that the bacterial inoculation of corn silage had no significant effect on milk production, although it increased 3.5% fat corrected milk, percentages of milk fat and protein as well as digestibility of nutrients. ذرت علوفه‌ای با 28 درصد ماده‌خشک برداشت، خردشده و پس از اعمال تیمارهای آزمایشی (106 کلنی به ازای گرم علوفه تازه) در کیسه‌های 30 کیلوگرمی سیلو شدند. تیمارهای آزمایشی عبارت بودند از: 1) سیلاژ بدون تلقیح میکروبی(شاهد)، 2) سیلاژ تلقیح‌شده با لاکتوباسیلوس ‌فرمنتوم تولیدشده در آزمایشگاه، 3) سیلاژ تلقیح‌شده با مخلوطی از لاکتوباسیلوس ‌فرمنتوم، لاکتوباسیلوس ‌سالیواریوس، پدیوکوکوس ‌اسیدی‌لاکتیسی و انتروکوکوس ‌فاسیوم، تولیدشده در آزمایشگاه و 4) سیلاژ تلقیح‌شده با باکتری تجاری حاوی انتروکوکوس ‌فاسیوم، لاکتوباسیلوس ‌برویس و لاکتوباسیلوس ‌پلانتاروم. شانزده رأس گاو هلشتاین در اواسط شیردهی ( 0/10 ± 160 روز شیردهی) بر پایة طرح مربع‌لاتین ادغام شده 4 ×4 با دوره‌های 21 روزه استفاده شد. تولید شیر تیمارهای آزمایشی با شاهد تفاوتی نداشت ولی تولید شیر تصحیح‌شده بر اساس 5/3 درصد چربی در گاوهای دریافت‌کننده سیلاژ تلقیح‌شده بیشتر از شاهد بود. درصدهای چربی، پروتئین و مواد جامد بدون چربی شیر در تیمار اول بیشتر از گروه‌های دیگر بود. گاوهای تغذیه‌شده با سیلاژهای تلقیح‌شده آزمایشگاهی، مصرف ماده‌خشک بالاتری نسبت به شاهد و تیمار سوم داشتند. گوارش‌پذیری ماده‌خشک، پروتئین خام و الیاف نامحلول در شوینده اسیدی در تیمارهای تلقیح‌شده بالاتر از شاهد بود و بیشترین آن مربوط به تیمار دوم بود. غلظت نیتروژن آمونیاکی شکمبه در تیمارهای اول و دوم کمتر از شاهد بود. درصد استات شکمبه در شاهد و تیمار دوم بالاتر و پروپیونات در تیمارهای تلقیح شده بیشتر از شاهد بود. نتایج نشان داد تلقیح باکتریایی سیلاژ ذرت تاثیر معنی‌داری بر میزان تولید شیر نداشت هرچند شیر تصحیح‌شده 5/3 درصد چربی، درصدهای چربی و پروتئین شیر و گوارش‌پذیری مواد مغذی را افزایش داد.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97791_990daec1172db9b283cff59114def7dd.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Study of population structure and linkage disequilibrium pattern of Iranian native horse breeds by SNP markers بررسی ساختار جمعیتی و الگوی عدم تعادل پیوستگی اسب‌های بومی ایران با استفاده از نشانگرهای SNP 769 786 97783 10.22059/ijas.2024.367367.653968 FA محمد عبدلی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران. 0009-0000-4984-6953 محمد باقر زندی باغچه مریم گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران. محمد طاهر هرکی نژاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان. ایران. 0000-0001-9037-824X معین تاند گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان. ایران. Journal Article 2023 11 07 The aim of this study was to investigate the structure and genetic distances, inbreeding, and linkage disequilibrium (LD) in Iranian native horse breeds. Samples on 167 horses including Arabian Asil (24), Caspian (22), Dareshouri (15), Kurdish (66), and Turkmen (40) breeds were used. The samples were genotyped using Illumina 70k SNP equine bead chip. Data quality control was applied and loci with MAF < 2%, Mind < 5%, HWE (<10-6), and genotype call rate < 1% were removed. Finally, 159 horses with 45,270 SNP loci were reminded for the genetic structure analyse. Clustering analyse showed that in K=5 Caspian and Kurdish breeds were placed in a common cluster, and Turkmen, Dareshouri, and Arabian Asil breeds were also located in distinct clusters. The LD decay among all breeds showed a significant decrease below 400 bp. Caspian and Dareshouri breeds experienced the lowest and highest LD and the highest and lowest effective population size, respectively. The inbreeding value based on the runs of homozygosity (ROH) were highest and lowest for Arabian Asil and Caspian breeds, respectively. The results showed that the Iranian native horse breeds were well identified by SNP markers, which can be used for stud base foundations of breeds with more accuracy. هدف این پژوهش، بررسی ساختار و فواصل ژنتیکی، هم‌خونی و الگوی عدم تعادل پیوستگی (LD) و درک روابط بین نژادهای اسب بومی ایران بود. در مجموع از 167 راس اسب که شامل 24 راس از نژاد عرب (اصیل)، 24 راس نژاد کاسپین، 15 راس نژاد دره‌شوری، 66 راس نژاد کرد و 40 راس ترکمن بودند، استفاده شد. نمونه‌ها با استفاده از تراشه (Illumina 70k SNP equine bead chip) ژنوتایپ شدند. در پالایش داده‌ها، جایگاه‌هایی با MAF کمتر از 2 درصد، Mind کمتر از 5 درصد، HWE کمتر از و ژنوتاپت‌های کمتر از 01/0 حذف شدند و 45270 جایگاه SNP در 159 راس اسب برای آنالیزهای بررسی ساختار ژنتیکی اسب‌های بومی ایران به کار گرفته شد. تجزیه‌ ساختار ژنتیکی نشان داد که در K=5 نژادهای کاسپین و کرد در یک خوشه مشترک قرار گرفتند و نژادهای ترکمن، دره‌شوری و عرب (اصیل) نیز خوشه‌های متمایزی تشکیل دادند. فاز LD در بین تمام نژادها در فاصله زیر bp400 کاهش معناداری داشت. نژاد کاسپین و دره‌شوری به ترتیب کم‌ترین و بیش‌ترین LD و بیش‌ترین و کم‌ترین اندازه موثر جمعیت را تجربه کردند. کم‌ترین و بیش‌ترین ضریب هم‌خونی براساس رشته‌های هموزیگوت ژنومی (ROH) نیز به ترتیب در نژادهای عرب اصیل و کاسپین دیده شد. نتایج نشان داد نژادهای بومی اسب ایران به خوبی با نشانگرهای (SNP) شناسایی شدند که این موضوع می‌تواند در تشکیل پایه‌های ژنومی نژادها (Data Base) و با صحت بالا مورد استفاده قرار گیرد.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97783_4ed694b618a513a0ab7e7d4116d967ac.pdf

دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 55 4 2024 12 21 Study of environmental factors affecting the quantity and quality of Saanen goat milk production in Shahrekord بررسی عوامل محیطی ﻣﺆثر بر کمیت و کیفیت شیر تولیدی بزسانن در شهرکرد 787 802 97785 10.22059/ijas.2024.368143.653974 FA ابراهیم اسدی خشویی گروه مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران. سید رضا میرائی آشتیانی گروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، دانشگاه تهران، کرج، ایران 0000-0003-3597-4385 مریم السادات حسینی گروه مهندسی علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران Journal Article 2023 11 15 Milk production in goats is affected by genetic and environmental factors. Thus having knowledge about these factors is necessary for effective management and accurate estimation of animals breeding value. Data which were collected during 7 years (2002-2009) in the Animal Breeding Research Station of Shahrekord University were used to study the influence of environmental factors on milk production and composition of Saanen goats in this research. Repeated measurements were analysed using mixed model by including year, month, type of kidding, parity and week of lactation as fixed factors and the goat effect as a random factor. The fat percentage and the milk production on the test day were significantly influenced by all of mentioned factors (p<0.05). Month of kidding had no significant influence on protein and total-solid-non fat content (p>0. 05), and the parity had significant influence on all milk production traits (p<0.01). The highest daily milk production was belonged to goats with kidding months of February (2.59 ± 0.17 kg), twining goats (2.06 ± 0.16 kg) and in the fifth parity (2.54 ± 0.22 kg). As lactation progressed, the fat, lactose and total fat content increased. Milk protein content were decreased from early to the middle of lactation stage. Attention to non-genetic factors is necessary for efficient seleciom , establishing appropriate management practices, and ensuring stable milk production in lactating Saanen goats. صفات تولید شیر در بزها به طور بالقوه تحت تأثیر عوامل مختلف ژنتیکی و غیر ژنتیکی است و بنابر این علاوه بر شناخت عوامل ژنتیکی، آگاهی از تأثیر عوامل غیر ژنتیکی برای مدیریت کارآمد و برآورد دقیق ارزشهای اصلاحی صفات مورد نظر ضروری است. به منظور بررسی اثر عوامل محیطی بر شیر تولیدی بزهای سانن و ترکیبات آن در شرایط آب و هوایی شهرکرد، از اطلاعات جمع آوری شده در ایستگاه تحقیقات پرورش دام دانشگاه شهرکرد طی مدت 7 سال (1381 تا 1388) بهره گیری شد. مجموعه دادهها با استفاده از مدل مختلط طبق اندازه گیری های مکرر برای عوامل ثابت سال، ماه، نوع، نوبت زایش، هفته شیردهی و اثر تصادفی بز تجزیه واریانس شدند. کلیه عوامل ثابت بر صفات شیر تولیدی روزانه و درصد چربی اثر معنیدار داشتند (01/0(p<. همچنین، عامل ماه زایش بر درصد پروتئین و مواد جامد بدون چربی اثر معنیدار نداشتند (05/0(p>. عامل نوبت زایش بر همه صفات شیر تولیدی تاثیر معنی دار داشت(01/0(p<. بالاترین تولید شیر روزانه مربوط به بزهای زایش کرده در بهمن ماه (17/0±59/2 کیلوگرم)، بزهای دوقلوزا (16/0±06/2 کیلوگرم) و نوبت زایش پنجم (22/0±54/2 کیلوگرم) بود. درصد چربی، لاکتوز و مواد جامد بدون چربی به طور قابل توجهی با سپری شدن مرحله شیردهی افزایش داشتند. درصد پروتئین از اوایل تا اواسط شیردهی کاهش یافت. بعنوان نتیجه گیری نهایی، توجه به عوامل غیر ژنتیکی شناخته شده برای افزایش کارایی انتخاب، تعریف شیوههای مدیریتی مناسب و تضمین سطح پایدار تولید در بزهای شیرده سانن در شرایط اقلیمی شهرکرد ضروری است.

https://ijas.ut.ac.ir/article_97785_63c997201d162335bf57305a55b93630.pdf