دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 48 3 2017 11 22 Study of Genetic variation in Iranian Kurdish horse using microsatellite marker بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت اسب کرد ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره 335 342 64304 10.22059/ijas.2017.237799.653544 FA مطهره اعلا امجدی دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج حسن مهربانی یگانه دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج مصطفی صادقی دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج Journal Article 2017 08 05 In this research genetic variation  using  6  microsatellite  loci  (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02,  ASB23)  was studied in Iranian Kurdish horse population .Whole blood samples were randomly collected  from  52 horses in  Kurdistan, Kermanshah, Elam, Western Azerbaijan, Esfahan, Kerman and Hamadan regions. DNA was extracted from blood samples. Polymerase chain reaction (PCR) was used for amplification of 6   microsatellite loci using pairs of standard specific primers. Then, the PCR products assessed with 8% silver-staining acrylamide gel and electrophoresed. All microsatellites loci were polymorphic. The number of alleles observed and expected hetrozygosities were calculated with Shannon Index. The largest and smallest number of alleles were observed in HMS07 locus (10 alleles) and HMS02 (4 alleles) respectively. Our results confirmed the high efficiency of microsatellite markers for assessing population structure in Iranian native horses. <strong>در این تحقیق با استفاده از شش نشانگر ریزماهواره </strong>(HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23)<strong> تنوع ژنتیکی درون جمعیت 52 نمونه اسب کرد اصیل که از استان­های کردستان، کرمانشاه، ایلام، آذربایجان غربی، اصفهان، کرمان و همدان به‌طور تصادفی نمونه‌گیری شده‌اند، بررسی شد. از نمونۀ خون</strong><strong>­</strong><strong>های گرفته‌شده </strong>DNA<strong> به روش</strong><strong> نمکی بهینه یافته استخراج شد. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (</strong>PCR<strong>) برای افزونش قطعه‌های شش جایگاه ریزماهواره با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی به‌صورت استاندارد انجام شد. آنگاه محصولات </strong> PCR<strong>شش جایگاه روی ژل اکریل آمید 8 درصد، الکتروفورز و رنگ‌آمیزی شد. جایگاه</strong><strong>­</strong><strong>ها در جمعیت مورد بررسی، چندشکلی بالایی را نشان دادند. شمار آلل­های مشاهده‌شده و آلل</strong><strong>­</strong><strong>های مؤثر و میزان ناخالصی (هتروزیگوسیتی) مورد انتظار و مشاهده‌شده و شاخص شانون برای همۀ جایگاه</strong><strong>­</strong><strong>ها محاسبه شد. نتایج این تحقیق نشان داد، شمار آلل</strong><strong>­</strong><strong>های شش جایگاه مورد بررسی،</strong> <strong>از 4 تا 10 آلل متغیر بودند. بیشترین آلل در جایگاه </strong> HMS07<strong> (ده آلل) و کمترین آلل در جایگاه </strong>HMS02<strong> (چهار آلل) مشاهده شد.</strong> <strong>با توجه به نتایج مشاهده‌شده، جایگاه</strong><strong>­</strong><strong>های ریزماهوارۀ مورد استفاده چندشکلی بالایی در جمعیت اسب کرد داشتند و می‌توان از چندشکلی بالای آن‌ها در بررسی‌های بعدی، به‌ویژه در بررسی‌های ژنتیک جمعیت استفاده کرد. آلل</strong><strong>­</strong><strong>ها و دامنه</strong><strong>­</strong><strong>های آللی جدید در اسب کرد، گویای تفاوت ساختاری جمعیتی آن‌ها با دیگر نژادهای اسب مورد بررسی در تحقیقات دیگر مانند اسب ترکمن و عرب است. </strong> https://ijas.ut.ac.ir/article_64304_db26cd008af6354fcb1a13de87ffd326.pdf