دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران علوم دامی ایران 2008-4773 57 1 2026 03 21 The effect of different levels of genotyped animals in ssGBLUP evaluation on accuracy and response to selection: A simulation study اثر سطوح مختلف دام‌های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP بر صحت و پاسخ به انتخاب: یک مطالعه شبیه‌سازی 101 112 103341 10.22059/ijas.2025.395855.654078 FA مهدی ایمانی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران. حسین مرادی شهربابک گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران. محمد مرادی شهربابک گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران. 0000-0002-5255-609X Journal Article 2025 05 31 The objective of this study was to investigate single step genomic BLUP (ssGBLUP) evaluation in different scenarios with different numbers of genotyped animals, pedigree errors and heritability using simulated data for weening weight of lambs. Different scenarios were simulated based on heritability and pedigree error, each of them with three levels, and genotyped animals based on five levels. Accuracy and response to selection were studied to compare different scenarios. The R environment was used to perform the simulation steps. With the increase in the percentage of genotyped animals in the ssGBLUP evaluation, the accuracy of selection increased and at different levels of heritability selection accuracy showed less difference. The mean accuracy in the scenario of non-genotyped animals with different levels of pedigree error and heritability was 0.5, and for the scenario with 100% of genotyped animals it was equal to 0.79. In the scenario with non-genotyped animals, pedigree error levels had an inverse relationship with the accuracy of the ssGBLUP evaluations. By increasing the percentage of genotyped animals, the effect of pedigree error with the accuracy of ssGBLUP evaluations becomes less. Also, with the increasing number of genotyped animals, response to selection mean increased. Pedigree error showed a significant effect in a scenario with non-genotyped animals. When the number of genotyped animals added the effect of pedigree error was adjusted and its effect on the response to selection rate decreased. According to obtained results, ssGBLUP evaluation is a suitable choice for genetic analysis of small animal populations. هدف پژوهش حاضر، بررسی اثر سطوح مختلف دام­های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP همراه با سطوح مختلف خطای شجره و وراثت­پذیری­ صفت از طریق شبیه­سازی بود. برای انجام تحقیق، صفت میانگین وزن شیرگیری بره­ها در طی پنج نسل شبیه سازی شد. از صحت انتخاب و پاسخ به انتخاب صفت مذکور برای مقایسه اثر سناریوهای مختلف استفاده شد. سناریوها شامل پنج سطح از دام­های تعیین ژنوتیپ شده و دو عامل خطای شجره و وراثت­پذیری، هرکدام با سه سطح بود. از نرم افزار R برای انجام این شبیه­سازی استفاده شد. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP، صحت انتخاب افزایش یافت ولی مقادیر عددی صحت انتخاب در سطوح مختلف وراثت­پذیری اختلاف کمتری نشان داد. میانگین صحت در سناریوی دام­های فاقد اطلاعات ژنوتیپی، و سطوح مختلف خطای شجره و وراثت­پذیری، 5/0 بود، و برای سناریوی با 100 درصد از دام­های تعیین ژنوتیپ شده، معادل 79/0 بود. در سناریوی دام­های فاقد اطلاعات ژنوتایپینگ، سطوح خطای شجره­ ارتباط معکوسی با صحت ارزیابی­های ssGBLUP داشت. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده، ارتباط خطای شجره با صحت ارزیابی­های ssGBLUP کمتر شد. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده، میانگین پاسخ به انتخاب نیز افزایش یافت. خطای شجره در سناریویی که تمام دام­های فاقد اطلاعات ژنوتیپی بودند اثر معنی داری را نشان داد. با افزایش درصد دام­های دارای اطلاعات ژنوتیپی، اثر خطای شجره­­تصحیح شده و اثر آن بر میزان پاسخ به انتخاب کمتر شد. با توجه به نتایج حاصله از تحقیق حاضر، می­توان گفت ssGBLUP گزینه بسیار مناسبی برای تحلیل ژنتیکی جمعیت­های دامی کوچک است. https://ijas.ut.ac.ir/article_103341_09dc01a8367b9c803578ebc1836808aa.pdf