TY - JOUR ID - 67978 TI - بررسی جمعیت مؤثر، نامتعادلی پیوستگی و ساختار بلوک تک‌جوری در گاومیش‌های نژاد آذربایجانی با استفاده از تراشه‌های متراکم نشانگری JO - علوم دامی ایران JA - IJAS LA - fa SN - 2008-4773 AU - فلاحی, محمد حسین AU - مرادی شهربابک, حسین AU - مرادی شهربابک, محمد AU - عبدالهی آرپناهی, رستم AD - دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج AD - استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج AD - استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج AD - استادیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران Y1 - 2018 PY - 2018 VL - 49 IS - 2 SP - 247 EP - 255 KW - اندازۀ مؤثر جمعیت KW - بلوک تک‌جوری KW - چند‌شکلی تک نوکلئوتیدی KW - گاومیش KW - نامتعادلی پیوستگی DO - 10.22059/ijas.2017.214013.653463 N2 - هدف از این پژوهش برآورد میزان نامتعادلی پیوستگی، تعیین ساختار بلوک­های تک‌جوری (هاپلوتیپی) و اندازۀ مؤثر جمعیت گاومیش آذربایجانی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای SNP پراکنده در سراسر ژنگان (ژنوم) حاصل از تراشه­های متراکمK 90 (SNPchip 90k) بود. حیوان‌های مورد بررسی و ارزیابی 243 رأس گاومیش آذربایجانی پراکنده در استان­های گیلان، اردبیل، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی بود. پس از کنترل کیفیت داده­های نژادگانی (ژنوتیپی)، 62141  SNP برای تجزیه‌وتحلیل ساختار جمعیت، شناسایی ساختار تک‌جور­ها و اندازۀ مؤثر جمعیت استفاده شد. بیشترین میانگین نامتعادلی پیوستگی در کل جمعیت در فاصلۀ بین 5/2 کیلو جفت باز تا 5 کیلو جفت باز بین 25/0-29­/0 و کمترین میانگین نامتعادلی پیوستگی (r2) در فاصلۀ 900-1000 کیلو جفت باز بین 014/0-012/0 به‌دست آمد. مقدار r2 با افزایش فاصلۀ میان جفت SNPها کاهش زیادی نشان داد. در کل نمونه­های تجزیه‌شده، 1693 بلوک مشاهده شد که 11 درصد کل SNPها درون بلوک­های تک‌جوری خوشه­بندی شدند و 4/3±202 مگا جفت باز از کل ژنگان اتوزومی را پوشش می­دهند.اندازۀ مؤثر جمعیت با استفاده از آمارۀ (r2) محاسبه شد. اندازۀ مؤثر جمعیت حدود دو نسل پیش نزدیک به 422 برآورد شد. UR - https://ijas.ut.ac.ir/article_67978.html L1 - https://ijas.ut.ac.ir/article_67978_7900a7a83d394c64447043720f836b68.pdf ER -