مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلول‌های بدنی گاوهای هلشتاین ایران

رستم پهلوان؛ محمد مرادی شهربابک؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ رستم عبداللهی آرپناهی

دوره 51، شماره 3 ، آذر 1399، ، صفحه 221-229

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2020.308210.653796

چکیده
  در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورم‌پستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طول‌عمر تولیدی و افزایش هزینه‌ها، سبب تحمیل زیان‌های اقتصادی جدی به این صنعت شده‌است. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلول‌های بدنی به‌عنوان یکی از شاخص‌های ارزیابی ...  بیشتر

ارزیابی استراتژی‌های اصلاح‌نژاد در مرغان بومی مازندران با استفاده از شبیه‌سازی رایانه‌ای

بابک عنایتی؛ امیر رشیدی؛ رستم عبداللهی آرپناهی؛ محمد رزم کبیر

دوره 49، شماره 4 ، اسفند 1397، ، صفحه 481-494

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2019.263077.653653

چکیده
  هدف از پژوهش کنونی مقایسه استراتژی‌های اصلاح نژاد در گله­ مرغ بومی مازندران به کمک شبیه­سازی رایانه‌ای بود. صفات شبیه‌سازی­شده، وزن بدن در زمان تولد (BW1)، هشت هفتگی (BW8)، دوازده هفتگی (BW12)، زمان بلوغ جنسی (BWM)، سن بلوغ جنسی (AFE)، وزن اولین تخم­ (EWM)، میانگین وزن تخم­مرغ در هفته­های 28 تا 32 (EW28-32) و تعداد تخم­مرغ (EN) بودند. در استراتژی ...  بیشتر

بررسی جمعیت مؤثر، نامتعادلی پیوستگی و ساختار بلوک تک‌جوری در گاومیش‌های نژاد آذربایجانی با استفاده از تراشه‌های متراکم نشانگری

محمد حسین فلاحی؛ حسین مرادی شهربابک؛ محمد مرادی شهربابک؛ رستم عبدالهی آرپناهی

دوره 49، شماره 2 ، شهریور 1397، ، صفحه 247-255

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2017.214013.653463

چکیده
  هدف از این پژوهش برآورد میزان نامتعادلی پیوستگی، تعیین ساختار بلوک­های تک‌جوری (هاپلوتیپی) و اندازۀ مؤثر جمعیت گاومیش آذربایجانی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای SNP پراکنده در سراسر ژنگان (ژنوم) حاصل از تراشه­های متراکمK 90 (SNPchip 90k) بود. حیوان‌های مورد بررسی و ارزیابی 243 رأس گاومیش آذربایجانی پراکنده در استان­های گیلان، اردبیل، ...  بیشتر

تأثیر اسناد کردن و تراکم نشانگری در بهبود درستی ارزیابی‌های ژنگانی

ناهید پرنا؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ مصطفی صادقی؛ رستم عبداللهی آرپناهی

دوره 49، شماره 1 ، خرداد 1397، ، صفحه 73-81

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.227090.653506

چکیده
  با دسترسی به اطلاعات نشانگرهای تک نوکلئوتیدی (SNP­)، پیش­بینی شایستگی ژنتیکی افراد بدون اطلاعات پدیدگانی (فنوتیپی) با استفاده از ارزیابی ژنگانی (ژنومی) امکان­پذیر شده است. لیکن، استفاده از تراشه (چیپ)‌های متراکم برای ارزیابی همۀ افراد جمعیت مقرون‌به‌صرفه نیست. برای دستیابی به بیشترین بازدهی در بررسی‌های ژنگانی می­توان گروهی ...  بیشتر

ارزیابی کارایی تکنیک نمونه‌‌گیری تجمعی بوت‌‌استرپ بر صحت روش بهترین پیش‌‌بینی نااُریب خطی ژنومی

خبات خیرآبادی؛ جمال فیاضی؛ هدایت اله روشنفکر؛ رستم عبداللهی آرپناهی

دوره 48، شماره 4 ، اسفند 1396، ، صفحه 573-584

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.248547.653596

چکیده
  به منظور افزایش صحت ارزیابی‌‌های روش بهترین پیش‌‌بینی نااُریب خطی ژنومی (GBLUP)، تکنیک نمونه‌‌گیری تجمعی بوت‌‌استرپ (بگینگ) بکار گرفته شد. بدین منظور ژنومی حاوی 10000 نشانگر تک‌‌نوکلئوتیدی دو آللی (SNP) با فواصل یکسان روی 10 کروموزوم هریک به طول 100 سانتی‌‌مورگان شبیه‌‌سازی شد. برای ایجاد عدم تعادل پیوستگی (LD) بین SNPها و جایگاه‌‌های‌ ...  بیشتر

برآورد فراسنجه‌های ژنتیکی صفت وزن تخم‌مرغ و وزن بدن در نتیجۀ اثر متقابل اجتماعی در یک لاین تجاری جوجۀ گوشتی

وحید عرب فیروزجایی؛ رستم عبداللهی آرپناهی؛ عبدالرضا صالحی

دوره 48، شماره 4 ، اسفند 1396، ، صفحه 585-592

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.248678.653598

چکیده
  اثر متقابل اجتماعی در میان افراد می­تواند نقش مهمی بر میزان عملکرد صفات تولیدی و صفات مرتبط با شایستگی در دام­های اهلی داشته باشد. به همین جهت در این بررسی اثر متقابل اجتماعی پن در یک لاین تجاری گوشتی برای دو صفت وزن تخم­مرغ و وزن بدن ارزیابی و در این پژوهش از داده­های 29645 پرنده واقع در مجتمع مرغ لاین آرین بابل‌کنار استفاده شد ...  بیشتر

ردیابی نشانه‌های انتخاب مثبت در نژاد‌های گوسفند ایرانی افشاری و مغانی با استفاده از اطلاعات ژنگانی

زهره یوسفی؛ محمدتقی بیگی نصیری؛ محمد حسین مرادی؛ رستم عبداللهی آرپناهی؛ مسعود شیرعلی

دوره 48، شماره 4 ، اسفند 1396، ، صفحه 593-602

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2018.245433.653589

چکیده
  شناسایی مناطق ژنگانی (ژنومی) تحت انتخاب مثبت از بحث‌های مهم در حوزۀ ژنتیک جمعیت است. هدف این تحقیق، شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان افشاری و مغانی است که تحت ­تأثیر انتخاب طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته­اند. برای این منظور 75 رأس گوسفند از دو نژاد افشاری (41 رأس) و مغانی (34 رأس)، با استفاده از آرایه­های ژنگانیIllumina Ovine SNP50K BeadChip تعیین نژادگان ...  بیشتر

تعیین شمار رکورد روز آزمون موردنیاز هر دام برای جایگزینی مدل رگرسیون تصادفی با مدل متداول دورۀ شیردهی

رستم عبداللهی آرپناهی؛ محمد رزم کبیر؛ محمدباقر صیادنژاد؛ علیرضا اقبال

دوره 48، شماره 3 ، آذر 1396، ، صفحه 391-398

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2017.240961.653555

چکیده
  با توسعۀ مدل‌های آماری مختلط برای ارزیابی صفات تکرارشده در طول زمان، مدل رگرسیون تصادفی (RRM) جایگزین مدل دورۀ شیردهی (LM) شده است. کمترین شمار رکورد روز آزمون لازم در هر دورۀ شیردهی به ازای هر حیوان برای جایگزینی LM با RRM یک چالش در ارزیابی ژنتیکی است. در این بررسی از 381236 رکورد روز آزمون مربوط به 44117 گاو شیری از هشت گله با دورۀ شیردهی اول ...  بیشتر

شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

مهدیه راستی فر؛ اردشیر نجاتی جوارمی؛ محمد حسین مرادی؛ رستم عبداللهی آرپناهی

دوره 46، شماره 1 ، فروردین 1394، ، صفحه 65-72

http://dx.doi.org/10.22059/ijas.2015.54592

چکیده
  هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه‌های مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه‌های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری‌بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه‌ها با استفاده از آرایه‌های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده‌های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز ...  بیشتر